論文の概要: Multi-objective point cloud autoencoders for explainable myocardial
infarction prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.11017v1
- Date: Thu, 20 Jul 2023 16:45:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-21 12:00:19.573478
- Title: Multi-objective point cloud autoencoders for explainable myocardial
infarction prediction
- Title(参考訳): 心筋梗塞予測のための多目的ポイントクラウドオートエンコーダ
- Authors: Marcel Beetz, Abhirup Banerjee, Vicente Grau
- Abstract要約: 心筋梗塞は世界で最も多い死因の1つである。
画像ベースのバイオマーカーは、心臓の3D解剖においてより複雑なパターンを捉えることができない。
本稿では,多目的クラウドオートエンコーダについて,説明可能な梗塞予測のための新しい幾何学的深層学習手法として紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.65840670565844
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Myocardial infarction (MI) is one of the most common causes of death in the
world. Image-based biomarkers commonly used in the clinic, such as ejection
fraction, fail to capture more complex patterns in the heart's 3D anatomy and
thus limit diagnostic accuracy. In this work, we present the multi-objective
point cloud autoencoder as a novel geometric deep learning approach for
explainable infarction prediction, based on multi-class 3D point cloud
representations of cardiac anatomy and function. Its architecture consists of
multiple task-specific branches connected by a low-dimensional latent space to
allow for effective multi-objective learning of both reconstruction and MI
prediction, while capturing pathology-specific 3D shape information in an
interpretable latent space. Furthermore, its hierarchical branch design with
point cloud-based deep learning operations enables efficient multi-scale
feature learning directly on high-resolution anatomy point clouds. In our
experiments on a large UK Biobank dataset, the multi-objective point cloud
autoencoder is able to accurately reconstruct multi-temporal 3D shapes with
Chamfer distances between predicted and input anatomies below the underlying
images' pixel resolution. Our method outperforms multiple machine learning and
deep learning benchmarks for the task of incident MI prediction by 19% in terms
of Area Under the Receiver Operating Characteristic curve. In addition, its
task-specific compact latent space exhibits easily separable control and MI
clusters with clinically plausible associations between subject encodings and
corresponding 3D shapes, thus demonstrating the explainability of the
prediction.
- Abstract(参考訳): 心筋梗塞(mi)は、世界で最も一般的な死因の1つである。
クリニックで一般的に使用される画像ベースのバイオマーカー、例えば放出分画は、心臓の3D解剖学におけるより複雑なパターンを捉えることができず、診断精度が制限される。
本稿では,心臓解剖学と機能学の多クラス3dポイントクラウド表現に基づいて,梗塞予測のための新しい幾何学的深層学習手法として,多目的ポイントクラウドオートエンコーダを提案する。
そのアーキテクチャは、低次元の潜在空間で接続された複数のタスク固有の分岐で構成され、リコンストラクションとmi予測の両方の効果的な多目的学習を可能にし、また、解釈可能な潜在空間で病理学的に特異的な3d形状情報をキャプチャする。
さらに、ポイントクラウドベースのディープラーニング操作を備えた階層的ブランチ設計により、高分解能の解剖学的ポイントクラウド上で直接、効率的なマルチスケール機能学習が可能になる。
大規模な英国バイオバンクデータセットを用いた実験では,マルチオブジェクト・ポイント・クラウド・オートエンコーダは,画像の画素解像度より下方にある予測と入力の解剖学の間のチャムファー距離で,複数の時間的3次元形状を正確に再構成することができる。
提案手法は,入射MI予測処理における複数の機械学習および深層学習ベンチマークを,受信者動作曲線の下での面積で19%向上させる。
また,そのタスクに特有なコンパクトな潜在性空間は,対象の符号化と対応する3次元形状との間に臨床的に妥当な関係を持つ分離可能な制御およびmiクラスターを示し,その予測可能性を示す。
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