論文の概要: A Compact Implicit Neural Representation for Efficient Storage of
Massive 4D Functional Magnetic Resonance Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.00082v2
- Date: Thu, 29 Feb 2024 15:32:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-01 18:14:03.635018
- Title: A Compact Implicit Neural Representation for Efficient Storage of
Massive 4D Functional Magnetic Resonance Imaging
- Title(参考訳): 大容量4次元機能的磁気共鳴画像の高効率記憶のための小型インシシティニューラル表現法
- Authors: Ruoran Li, Runzhao Yang, Wenxin Xiang, Yuxiao Cheng, Tingxiong Xiao,
Jinli Suo
- Abstract要約: fMRI圧縮は、複雑な時間的ダイナミクス、低信号-雑音比、複雑な基礎的冗長性のために、ユニークな課題を生んでいる。
Inlicit Neural Representation (INR)に基づくfMRIデータに適した新しい圧縮パラダイムについて報告する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.493622422645053
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI) data is a widely used kind of
four-dimensional biomedical data, which requires effective compression.
However, fMRI compressing poses unique challenges due to its intricate temporal
dynamics, low signal-to-noise ratio, and complicated underlying redundancies.
This paper reports a novel compression paradigm specifically tailored for fMRI
data based on Implicit Neural Representation (INR). The proposed approach
focuses on removing the various redundancies among the time series by employing
several methods, including (i) conducting spatial correlation modeling for
intra-region dynamics, (ii) decomposing reusable neuronal activation patterns,
and (iii) using proper initialization together with nonlinear fusion to
describe the inter-region similarity. This scheme appropriately incorporates
the unique features of fMRI data, and experimental results on publicly
available datasets demonstrate the effectiveness of the proposed method,
surpassing state-of-the-art algorithms in both conventional image quality
evaluation metrics and fMRI downstream tasks. This work in this paper paves the
way for sharing massive fMRI data at low bandwidth and high fidelity.
- Abstract(参考訳): 機能的磁気共鳴イメージング(fMRI)データは、4次元のバイオメディカルデータの一種であり、効果的な圧縮を必要とする。
しかし、fMRI圧縮は、複雑な時間的ダイナミクス、低信号-雑音比、複雑な基礎的冗長性のために、ユニークな課題を生んでいる。
本稿では,暗黙的神経表現(inr)に基づくfmriデータに特化した新しい圧縮パラダイムを提案する。
提案手法は時系列の様々な冗長性を取り除くことに焦点を当て,いくつかの手法を用いた。
(i)地域内ダイナミクスのための空間相関モデリング
二 再利用可能な神経細胞活性化パターンの分解及び
(iii) 固有初期化と非線形融合を用いて領域間の類似性を記述する。
この手法はfmriデータのユニークな特徴を適切に組み込んでおり、提案手法の有効性を示す実験結果として、従来の画像品質評価指標とfmri下流課題の両方において最先端アルゴリズムを上回っている。
本稿では,低帯域幅,高忠実度で大規模fmriデータを共有する方法を提案する。
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