論文の概要: Effect of structure-based training on 3D localization precision and
quality
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.17265v1
- Date: Fri, 29 Sep 2023 14:17:31 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2023-10-02 13:35:07.512330
- Title: Effect of structure-based training on 3D localization precision and
quality
- Title(参考訳): 3次元位置決め精度と品質に及ぼす構造ベーストレーニングの影響
- Authors: Armin Abdehkakha, Craig Snoeyink
- Abstract要約: 本研究では,単一分子局在化顕微鏡におけるCNNアルゴリズムの構造に基づくトレーニング手法を提案する。
このアプローチを従来のランダムベーストレーニング手法と比較し,LUENNパッケージをAIパイプラインとして利用した。
以上の結果から,超高分解能顕微鏡の高度化に向けた構造ベーストレーニングアプローチの可能性が示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This study introduces a structural-based training approach for CNN-based
algorithms in single-molecule localization microscopy (SMLM) and 3D object
reconstruction. We compare this approach with the traditional random-based
training method, utilizing the LUENN package as our AI pipeline. The
quantitative evaluation demonstrates significant improvements in detection rate
and localization precision with the structural-based training approach,
particularly in varying signal-to-noise ratios (SNRs). Moreover, the method
effectively removes checkerboard artifacts, ensuring more accurate 3D
reconstructions. Our findings highlight the potential of the structural-based
training approach to advance super-resolution microscopy and deepen our
understanding of complex biological systems at the nanoscale.
- Abstract(参考訳): 本研究では、単一分子局在化顕微鏡(SMLM)と3次元オブジェクト再構成におけるCNNアルゴリズムの構造に基づくトレーニング手法を提案する。
このアプローチを従来のランダムベーストレーニング手法と比較し,LUENNパッケージをAIパイプラインとして利用した。
定量的評価により, 検出率と位置推定精度は, 構造に基づくトレーニング手法, 特に信号-雑音比 (SNR) によって著しく向上した。
さらに、チェッカーボードのアーティファクトを効果的に除去し、より正確な3D再構成を実現する。
本研究は,超高分解能顕微鏡を応用し,ナノスケールでの複雑な生体システムの理解を深めるための構造ベーストレーニング手法の可能性を明らかにするものである。
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