論文の概要: LMT: Longitudinal Mixing Training, a Framework to Predict Disease
Progression from a Single Image
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.10420v1
- Date: Mon, 16 Oct 2023 14:01:20 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-17 14:07:38.965965
- Title: LMT: Longitudinal Mixing Training, a Framework to Predict Disease
Progression from a Single Image
- Title(参考訳): lmt:縦型混合訓練 : 一つの画像から疾患の進行を予測する枠組み
- Authors: Rachid Zeghlache, Pierre-Henri Conze, Mostafa El Habib Daho, Yihao Li,
Hugo Le boite, Ramin Tadayoni, Pascal Massin, B\'eatrice Cochener, Ikram
Brahim, Gwenol\'e Quellec, and Mathieu Lamard
- Abstract要約: 本稿では,2つの連続試験間の重み付き平均時間である$t_mix$を用いて,時間認識モデルのトレーニングを行う新しい方法を提案する。
AUCは0.798で、視線は0.641で、視線は1枚の画像で重篤なDRを発生させるかどうかを予測した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.805673949640389
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Longitudinal imaging is able to capture both static anatomical structures and
dynamic changes in disease progression toward earlier and better
patient-specific pathology management. However, conventional approaches rarely
take advantage of longitudinal information for detection and prediction
purposes, especially for Diabetic Retinopathy (DR). In the past years, Mix-up
training and pretext tasks with longitudinal context have effectively enhanced
DR classification results and captured disease progression. In the meantime, a
novel type of neural network named Neural Ordinary Differential Equation (NODE)
has been proposed for solving ordinary differential equations, with a neural
network treated as a black box. By definition, NODE is well suited for solving
time-related problems. In this paper, we propose to combine these three aspects
to detect and predict DR progression. Our framework, Longitudinal Mixing
Training (LMT), can be considered both as a regularizer and as a pretext task
that encodes the disease progression in the latent space. Additionally, we
evaluate the trained model weights on a downstream task with a longitudinal
context using standard and longitudinal pretext tasks. We introduce a new way
to train time-aware models using $t_{mix}$, a weighted average time between two
consecutive examinations. We compare our approach to standard mixing training
on DR classification using OPHDIAT a longitudinal retinal Color Fundus
Photographs (CFP) dataset. We were able to predict whether an eye would develop
a severe DR in the following visit using a single image, with an AUC of 0.798
compared to baseline results of 0.641. Our results indicate that our
longitudinal pretext task can learn the progression of DR disease and that
introducing $t_{mix}$ augmentation is beneficial for time-aware models.
- Abstract(参考訳): 経時的イメージングは、静的解剖学的構造と疾患進行のダイナミックな変化の両方を、より早くより優れた患者固有の病理管理に向けて捉えることができる。
しかし、従来のアプローチでは、特に糖尿病網膜症(DR)において、検出および予測目的の経時的情報を活用することはめったにない。
近年,縦断的文脈を伴うミックスアップトレーニングとプリテキストタスクは,dr分類結果とキャプチャー疾患の進行を効果的に改善している。
その間、ニューラルネットワークをブラックボックスとして扱う通常の微分方程式を解くために、ニューラル正規微分方程式(NODE)と呼ばれる新しいタイプのニューラルネットワークが提案されている。
定義上、NODEは時間関連の問題を解決するのに適している。
本稿では,DR進行の検出と予測にこれら3つの側面を組み合わせることを提案する。
我々のフレームワークであるLMT(Longitudinal Mixing Training)は、正規化と、潜在空間における疾患進行を符号化するプリテキストタスクの両方とみなすことができる。
さらに, 標準および縦方向のプリテキストタスクを用いて, 縦方向コンテキストを用いた下流タスクのモデル重み評価を行った。
2回の連続試験の間の重み付け平均時間である$t_{mix}$を用いて,時間認識モデルのトレーニング方法を提案する。
我々は、縦型網膜色素写真(CFP)データセットOPHDIATを用いたDR分類の標準混合訓練に対するアプローチの比較を行った。
aucは0.641の基準値と比較して0.798の1枚の画像を用いて、次の訪問で目が重度のdrを発症するかどうかを予測できた。
以上の結果から, DR 病の進行を学習し, $t_{mix}$ augmentation を導入することは, 時間認識モデルに有用であることが示唆された。
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