論文の概要: AdaMedGraph: Adaboosting Graph Neural Networks for Personalized Medicine
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.14304v1
- Date: Fri, 24 Nov 2023 06:27:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-27 15:48:57.776471
- Title: AdaMedGraph: Adaboosting Graph Neural Networks for Personalized Medicine
- Title(参考訳): AdaMedGraph: パーソナライズドメディカルのためのグラフニューラルネットワーク
- Authors: Jie Lian, Xufang Luo, Caihua Shan, Dongqi Han, Varut Vardhanabhuti,
Dongsheng Li
- Abstract要約: 我々は,複数の患者類似性グラフを構築するために重要な特徴を自動選択するアルゴリズム,我が社の提案するアルゴリズムを提案する。
実世界の医療シナリオを2つ評価し,優れた成績を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 31.424781716926848
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Precision medicine tailored to individual patients has gained significant
attention in recent times. Machine learning techniques are now employed to
process personalized data from various sources, including images, genetics, and
assessments. These techniques have demonstrated good outcomes in many clinical
prediction tasks. Notably, the approach of constructing graphs by linking
similar patients and then applying graph neural networks (GNNs) stands out,
because related information from analogous patients are aggregated and
considered for prediction. However, selecting the appropriate edge feature to
define patient similarity and construct the graph is challenging, given that
each patient is depicted by high-dimensional features from diverse sources.
Previous studies rely on human expertise to select the edge feature, which is
neither scalable nor efficient in pinpointing crucial edge features for complex
diseases. In this paper, we propose a novel algorithm named \ours, which can
automatically select important features to construct multiple patient
similarity graphs, and train GNNs based on these graphs as weak learners in
adaptive boosting. \ours{} is evaluated on two real-world medical scenarios and
shows superiors performance.
- Abstract(参考訳): 近年,個別患者に適した精密医療が注目されている。
画像や遺伝学、評価など、さまざまなソースからパーソナライズされたデータを処理するために、機械学習技術が使用されている。
これらの技術は多くの臨床予測タスクにおいて良い結果を示した。
特に類似した患者をリンクしてグラフニューラルネットワーク(gnns)を適用することによりグラフを構築するアプローチは際立っている。
しかし,各患者が多種多様な情報源から高次元の特徴によって描写されることを考えると,患者の類似性を定義してグラフを構築するのに適したエッジ特徴を選択することは困難である。
これまでの研究では、エッジ機能の選択に人間の専門知識に依存しており、複雑な疾患の重要なエッジ機能を特定するのにスケーラブルでも効率的でもない。
本稿では,複数の患者類似性グラフを構築するために重要な特徴を自動的に選択し,これらのグラフに基づいてGNNを適応的ブースティングにおける弱い学習者として訓練する,‘ours’というアルゴリズムを提案する。
\ours{}は2つの現実世界の医療シナリオで評価され、優れたパフォーマンスを示す。
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