論文の概要: Spinal Muscle Atrophy Disease Modelling as Bayesian Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.17521v1
- Date: Wed, 29 Nov 2023 10:45:27 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-30 21:40:44.305750
- Title: Spinal Muscle Atrophy Disease Modelling as Bayesian Network
- Title(参考訳): ベイジアンネットワークをモデルとした脊髄筋萎縮症
- Authors: Mohammed Ezzat Helal, Manal Ezzat Helal, Sherif Fadel Fahmy
- Abstract要約: 本稿では,確率的図形モデルとベイズ推論を用いた疾患モデリングのための分子遺伝子発現研究と公開データベースについて検討する。
脊髄筋萎縮性ゲノム関連研究のケーススタディをモデル化し分析した。
疾患発生の2段階におけるアップ・アンド・ダウン制御遺伝子は、パブリックドメインで発行された先行知識と関連付けられ、共発現ネットワークが作成・解析される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We investigate the molecular gene expressions studies and public databases
for disease modelling using Probabilistic Graphical Models and Bayesian
Inference. A case study on Spinal Muscle Atrophy Genome-Wide Association Study
results is modelled and analyzed. The genes up and down-regulated in two stages
of the disease development are linked to prior knowledge published in the
public domain and co-expressions network is created and analyzed. The Molecular
Pathways triggered by these genes are identified. The Bayesian inference
posteriors distributions are estimated using a variational analytical algorithm
and a Markov chain Monte Carlo sampling algorithm. Assumptions, limitations and
possible future work are concluded.
- Abstract(参考訳): 確率的グラフィカルモデルとベイズ推論を用いた疾患モデリングのための分子遺伝子発現研究と公開データベースについて検討した。
脊髄筋萎縮性ゲノム関連研究のケーススタディをモデル化し分析した。
疾患発生の2段階におけるアップ・アンド・ダウン制御遺伝子は、パブリックドメインで発行された先行知識と関連付けられ、共発現ネットワークが作成・解析される。
これらの遺伝子によって引き起こされる分子経路が同定される。
ベイズ推定の後方分布は変分解析アルゴリズムとマルコフ連鎖モンテカルロサンプリングアルゴリズムを用いて推定される。
仮定、限界、将来の仕事の可能性は結論づけられる。
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