論文の概要: Investigating a domain adaptation approach for integrating different
measurement instruments in a longitudinal clinical registry
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.00616v1
- Date: Fri, 1 Dec 2023 14:28:37 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-12-04 14:20:40.461890
- Title: Investigating a domain adaptation approach for integrating different
measurement instruments in a longitudinal clinical registry
- Title(参考訳): 縦断的臨床登録簿における異なる計測機器の統合のためのドメイン適応手法の検討
- Authors: Maren Hackenberg, Michelle Pfaffenlehner, Max Behrens, Astrid
Pechmann, Janbernd Kirschner, Harald Binder
- Abstract要約: 本稿では,共同潜在表現を得るための深層学習手法について検討する。
これは、画像データのためのコンピュータ科学において確立された概念であるドメイン適応に対応している。
ドメイン適応は, 時系列レジストリデータの統計的モデリングにおいて, より一般的に有用である可能性が示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In a longitudinal clinical registry, different measurement instruments might
have been used for assessing individuals at different time points. To combine
them, we investigate deep learning techniques for obtaining a joint latent
representation, to which the items of different measurement instruments are
mapped. This corresponds to domain adaptation, an established concept in
computer science for image data. Using the proposed approach as an example, we
evaluate the potential of domain adaptation in a longitudinal cohort setting
with a rather small number of time points, motivated by an application with
different motor function measurement instruments in a registry of spinal
muscular atrophy (SMA) patients. There, we model trajectories in the latent
representation by ordinary differential equations (ODEs), where person-specific
ODE parameters are inferred from baseline characteristics. The goodness of fit
and complexity of the ODE solutions then allows to judge the measurement
instrument mappings. We subsequently explore how alignment can be improved by
incorporating corresponding penalty terms into model fitting. To systematically
investigate the effect of differences between measurement instruments, we
consider several scenarios based on modified SMA data, including scenarios
where a mapping should be feasible in principle and scenarios where no perfect
mapping is available. While misalignment increases in more complex scenarios,
some structure is still recovered, even if the availability of measurement
instruments depends on patient state. A reasonable mapping is feasible also in
the more complex real SMA dataset. These results indicate that domain
adaptation might be more generally useful in statistical modeling for
longitudinal registry data.
- Abstract(参考訳): 長期臨床登録では、異なる時点の個人を評価するために異なる測定装置が使用された可能性がある。
これらを組み合わせるために,異なる測定器の項目をマッピングするジョイント潜在表現を得るための深層学習手法について検討した。
これは画像データのためのコンピュータサイエンスにおける確立された概念であるドメイン適応に対応する。
提案手法を例に,脊髄筋萎縮症(sma)患者の登録簿における運動機能計測器の異なる応用によって動機づけられた,比較的少ない時間点の縦型コホート設定における領域適応の可能性を評価する。
そこで,通常の微分方程式(ODE)による潜在表現の軌跡をモデル化し,基本特性から個人固有のODEパラメータを推定する。
ODEソリューションの適合性と複雑性の良さにより、測定器のマッピングを判断することができる。
次に、対応するペナルティ項をモデルフィッティングに組み込むことでアライメントを改善する方法について検討する。
測定器間の差分の影響を系統的に検討するために,修正SMAデータに基づくいくつかのシナリオを検討する。
より複雑なシナリオでは誤調整が増加するが、測定器の可用性が患者の状態に依存する場合でも、一部の構造は回復される。
より複雑な実SMAデータセットでも、合理的なマッピングが実現可能である。
これらの結果は、縦断レジストリデータの統計モデリングにおいて、ドメイン適応がより一般的に有用であることを示している。
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