論文の概要: Distributed Reinforcement Learning for Molecular Design: Antioxidant
case
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.01267v1
- Date: Sun, 3 Dec 2023 03:23:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-12-05 18:19:29.093705
- Title: Distributed Reinforcement Learning for Molecular Design: Antioxidant
case
- Title(参考訳): 分子設計のための分散強化学習:アンチオキシダントの場合
- Authors: Huanyi Qin, Denis Akhiyarov, Sophie Loehle, Kenneth Chiu, and Mauricio
Araya-Polo
- Abstract要約: DA-MolDQNは抗酸化剤の分散強化学習アルゴリズムである。
従来のアルゴリズムよりも100倍高速で、プロプライエタリおよびパブリックな抗酸化物質から新しい最適化された分子を発見することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.20971479389679337
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep reinforcement learning has successfully been applied for molecular
discovery as shown by the Molecule Deep Q-network (MolDQN) algorithm. This
algorithm has challenges when applied to optimizing new molecules: training
such a model is limited in terms of scalability to larger datasets and the
trained model cannot be generalized to different molecules in the same dataset.
In this paper, a distributed reinforcement learning algorithm for antioxidants,
called DA-MolDQN is proposed to address these problems. State-of-the-art bond
dissociation energy (BDE) and ionization potential (IP) predictors are
integrated into DA-MolDQN, which are critical chemical properties while
optimizing antioxidants. Training time is reduced by algorithmic improvements
for molecular modifications. The algorithm is distributed, scalable for up to
512 molecules, and generalizes the model to a diverse set of molecules. The
proposed models are trained with a proprietary antioxidant dataset. The results
have been reproduced with both proprietary and public datasets. The proposed
molecules have been validated with DFT simulations and a subset of them
confirmed in public "unseen" datasets. In summary, DA-MolDQN is up to 100x
faster than previous algorithms and can discover new optimized molecules from
proprietary and public antioxidants.
- Abstract(参考訳): 分子ディープqネットワーク(moldqn)アルゴリズムによって示されるように、深層強化学習は分子発見にうまく適用されている。
このようなモデルのトレーニングは、より大きなデータセットへの拡張性という点で制限されており、トレーニングされたモデルは、同じデータセット内の異なる分子に一般化することはできない。
本稿では,DA-MolDQNと呼ばれる抗酸化剤の分散強化学習アルゴリズムを提案する。
最先端結合解離エネルギー(BDE)とイオン化ポテンシャル(IP)予測器は、抗酸化物質を最適化しながら重要な化学的性質であるDA-MolDQNに統合される。
トレーニング時間はアルゴリズムによる分子修飾の改善によって短縮される。
アルゴリズムは分散され、最大512個の分子に対してスケーラブルであり、モデルを様々な分子に一般化する。
提案されたモデルはプロプライエタリな抗酸化物質データセットでトレーニングされる。
結果はプロプライエタリデータセットとパブリックデータセットの両方で再現されている。
提案する分子はdftシミュレーションによって検証され、そのサブセットはパブリックな"アンセエン"データセットで確認されている。
要約すると、DA-MolDQNは従来のアルゴリズムよりも100倍高速で、プロプライエタリおよびパブリックな抗酸化物質から新しい最適化された分子を発見できる。
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