論文の概要: Resource-Limited Automated Ki67 Index Estimation in Breast Cancer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.00014v1
- Date: Fri, 22 Dec 2023 16:33:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-15 12:26:22.902725
- Title: Resource-Limited Automated Ki67 Index Estimation in Breast Cancer
- Title(参考訳): 乳癌におけるリソース制限自動Ki67指数の推定
- Authors: J. Gliozzo, G. Marin\`o, A. Bonometti, M. Frasca and D. Malchiodi
- Abstract要約: 深部神経ネットワーク(DNN)は、がん細胞においてKi67の発現を推定し、腫瘍内TILのスコアを同時に決定する上で最高の結果をもたらすことが示されている。
乳癌検診におけるKi67陽性細胞の割合を効果的に推定するための資源消費を考慮したDNNを提案する。
提案手法では, メモリ使用量の75%と89%を削減し, エネルギー消費量を1.5倍に削減し, ベンチマーク・オブ・ザ・テクス・ソリューションの総合的精度を向上した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The prediction of tumor progression and chemotherapy response has been
recently tackled exploiting Tumor Infiltrating Lymphocytes (TILs) and the
nuclear protein Ki67 as prognostic factors. Recently, deep neural networks
(DNNs) have been shown to achieve top results in estimating Ki67 expression and
simultaneous determination of intratumoral TILs score in breast cancer cells.
However, in the last ten years the extraordinary progress induced by deep
models proliferated at least as much as their resource demand. The exorbitant
computational costs required to query (and in some cases also to store) a deep
model represent a strong limitation in resource-limited contexts, like that of
IoT-based applications to support healthcare personnel. To this end, we propose
a resource consumption-aware DNN for the effective estimate of the percentage
of Ki67-positive cells in breast cancer screenings. Our approach reduced up to
75% and 89% the usage of memory and disk space respectively, up to 1.5x the
energy consumption, and preserved or improved the overall accuracy of a
benchmark state-of-the-art solution. Encouraged by such positive results, we
developed and structured the adopted framework so as to allow its general
purpose usage, along with a public software repository to support its usage.
- Abstract(参考訳): 腫瘍進展と化学療法反応の予測は、最近、腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)と核タンパク質Ki67を予後因子として用いている。
近年,深層ニューラルネットワーク (dnns) が乳癌細胞においてki67の発現を推定し,腫瘍内tilsスコアを同時決定する結果が得られた。
しかし、この10年間で、深層モデルによって引き起こされた異常な進歩は、少なくとも資源需要と同じくらいに増大した。
深層モデルのクエリに必要な計算コストは、IoTベースのアプリケーションのように、リソース制限の強い制限を表している(場合によっては保存する)。
そこで本研究では,乳がん検診においてki67陽性細胞の割合を効果的に推定するための資源消費対応dnnを提案する。
提案手法では, メモリ使用量の75%と89%を削減し, エネルギー消費量を1.5倍に削減し, ベンチマーク・オブ・ザ・アート・ソリューションの総合的精度を向上した。
このようなポジティブな結果に刺激されて,我々は,その汎用利用を可能にするために採用したフレームワークと,その利用をサポートするパブリックソフトウェアリポジトリを開発,構成した。
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