論文の概要: Transfer Learning for the Prediction of Entity Modifiers in Clinical
Text: Application to Opioid Use Disorder Case Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.15222v1
- Date: Fri, 26 Jan 2024 22:19:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-30 19:24:26.538422
- Title: Transfer Learning for the Prediction of Entity Modifiers in Clinical
Text: Application to Opioid Use Disorder Case Detection
- Title(参考訳): 臨床テキストにおけるエンティティ修飾子の予測のための伝達学習:オピオイド使用障害検出への応用
- Authors: Abdullateef I. Almudaifer, Tobias O`Leary, Whitney Covington, JaMor
Hairston, Zachary Deitch, Ankit Anand, Caleb M. Carroll, Estera Crisan,
William Bradford, Lauren Walter, Eaton Ellen, Sue S. Feldman and John D.
Osborne
- Abstract要約: 変調器の学習と予測を共同で行うマルチタスクトランスフォーマーアーキテクチャの開発と評価を行う。
共有モデルから学習した重みを、部分的に一致した新しいデータセットに効果的に転送できることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.0717129062292254
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Background: The semantics of entities extracted from a clinical text can be
dramatically altered by modifiers, including entity negation, uncertainty,
conditionality, severity, and subject. Existing models for determining
modifiers of clinical entities involve regular expression or features weights
that are trained independently for each modifier.
Methods: We develop and evaluate a multi-task transformer architecture design
where modifiers are learned and predicted jointly using the publicly available
SemEval 2015 Task 14 corpus and a new Opioid Use Disorder (OUD) data set that
contains modifiers shared with SemEval as well as novel modifiers specific for
OUD. We evaluate the effectiveness of our multi-task learning approach versus
previously published systems and assess the feasibility of transfer learning
for clinical entity modifiers when only a portion of clinical modifiers are
shared.
Results: Our approach achieved state-of-the-art results on the ShARe corpus
from SemEval 2015 Task 14, showing an increase of 1.1% on weighted accuracy,
1.7% on unweighted accuracy, and 10% on micro F1 scores.
Conclusions: We show that learned weights from our shared model can be
effectively transferred to a new partially matched data set, validating the use
of transfer learning for clinical text modifiers
- Abstract(参考訳): 背景: 臨床テキストから抽出されたエンティティのセマンティクスは, 実体否定, 不確実性, 条件性, 深刻度, 主観などの修飾によって劇的に変化する。
臨床実体の修飾者を決定する既存のモデルは、各修飾者のために独立に訓練された正規表現または特徴重みを含む。
方法:SemEval 2015 Task 14コーパスと,SemEvalと共有する修飾子とOUD特有の新規修飾子を含む新しいOpioid Use Disorder (OUD)データセットを用いて,修飾子を学習・予測するマルチタスクトランスフォーマーアーキテクチャの設計を開発し,評価する。
本研究は, 複数タスク学習手法の有効性を, 既に公表されているシステムに対して評価し, 臨床組織修飾体の一部を共有する場合に, 移行学習の有効性を評価する。
結果:SemEval 2015 Task 14のShAReコーパスでは,重み付け精度が1.1%,非重み付け精度が1.7%,マイクロF1スコアが10%向上した。
結論: 共有モデルから学習した重みを部分的に一致した新しいデータセットに効果的に変換できることを示し, 臨床用テキスト修正器における転写学習の有用性を検証した。
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