論文の概要: Survival modeling using deep learning, machine learning and statistical methods: A comparative analysis for predicting mortality after hospital admission
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.06999v1
- Date: Mon, 4 Mar 2024 10:46:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-17 16:41:26.715067
- Title: Survival modeling using deep learning, machine learning and statistical methods: A comparative analysis for predicting mortality after hospital admission
- Title(参考訳): ディープラーニング・機械学習・統計的手法を用いた生存モデリング:入院後の死亡予測のための比較分析
- Authors: Ziwen Wang, Jin Wee Lee, Tanujit Chakraborty, Yilin Ning, Mingxuan Liu, Feng Xie, Marcus Eng Hock Ong, Nan Liu,
- Abstract要約: コックス比例ハザード(CoxPH)、ステップワイドコックスPH、弾性ネットペナル化コックスモデル、GBM学習など、いくつかの生存分析手法の比較研究を行った。
症例スタディとして,2017年から2019年にかけて,第3次病院救急外来で入院した患者の振り返り分析を行った。
C-indexの結果は、ディープラーニングが同等のパフォーマンスを達成し、DeepSurvが最高の差別を生み出していることを示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.719996519981333
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Survival analysis is essential for studying time-to-event outcomes and providing a dynamic understanding of the probability of an event occurring over time. Various survival analysis techniques, from traditional statistical models to state-of-the-art machine learning algorithms, support healthcare intervention and policy decisions. However, there remains ongoing discussion about their comparative performance. We conducted a comparative study of several survival analysis methods, including Cox proportional hazards (CoxPH), stepwise CoxPH, elastic net penalized Cox model, Random Survival Forests (RSF), Gradient Boosting machine (GBM) learning, AutoScore-Survival, DeepSurv, time-dependent Cox model based on neural network (CoxTime), and DeepHit survival neural network. We applied the concordance index (C-index) for model goodness-of-fit, and integral Brier scores (IBS) for calibration, and considered the model interpretability. As a case study, we performed a retrospective analysis of patients admitted through the emergency department of a tertiary hospital from 2017 to 2019, predicting 90-day all-cause mortality based on patient demographics, clinicopathological features, and historical data. The results of the C-index indicate that deep learning achieved comparable performance, with DeepSurv producing the best discrimination (DeepSurv: 0.893; CoxTime: 0.892; DeepHit: 0.891). The calibration of DeepSurv (IBS: 0.041) performed the best, followed by RSF (IBS: 0.042) and GBM (IBS: 0.0421), all using the full variables. Moreover, AutoScore-Survival, using a minimal variable subset, is easy to interpret, and can achieve good discrimination and calibration (C-index: 0.867; IBS: 0.044). While all models were satisfactory, DeepSurv exhibited the best discrimination and calibration. In addition, AutoScore-Survival offers a more parsimonious model and excellent interpretability.
- Abstract(参考訳): 生存分析は、時間から時間までの結果を研究し、時間とともに起こる事象の確率を動的に理解するために不可欠である。
従来の統計モデルから最先端の機械学習アルゴリズムまで、さまざまなサバイバル分析技術は、医療介入と政策決定をサポートする。
しかし、その比較性能については現在も議論が続いている。
コックス比例ハザード(CoxPH)、ステップワイドコックスPH、弾性ネットペナル化コックスモデル(RSF)、ランダムサバイバルフォレスト(Random Survival Forests)、グラディエントブースティングマシン(GBM)学習、オートスコアサバイバル(AutoScore-Survival)、ディープサーブ(DeepSurv)、ニューラルネットワーク(CoxTime)に基づく時間依存コックスモデル(DeepHitサバイバルニューラルネットワーク)など、いくつかの生存分析手法の比較検討を行った。
モデル適合度にはコンコーダンス指標(C-index)を適用し,キャリブレーションには積分ブライアスコア(IBS)を適用し,モデルの解釈可能性を検討した。
ケーススタディでは,2017年から2019年まで,第3次病院救急科で入院した患者の振り返り分析を行い,患者の人口動態,臨床病理学的特徴,過去のデータから90日間の死亡率を予測した。
C-indexの結果、DeepSurvは最高の差別を生み出す(DeepSurv: 0.893; CoxTime: 0.892; DeepHit: 0.891)。
DeepSurv (IBS: 0.041) のキャリブレーションは最高であり、次に RSF (IBS: 0.042) と GBM (IBS: 0.0421) が全変数を使用した。
さらに、AutoScore-Survivalは最小限の変数部分集合を使い、容易に解釈でき、優れた識別と校正を行うことができる(C-index: 0.867; IBS: 0.044)。
すべてのモデルは満足のいくものだったが、DeepSurvは最高の差別と校正を示した。
さらにAutoScore-Survivalは、より微妙なモデルと優れた解釈性を提供する。
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