論文の概要: Comparison of static and dynamic random forests models for EHR data in the presence of competing risks: predicting central line-associated bloodstream infection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.16127v2
- Date: Fri, 24 May 2024 16:43:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-27 20:27:27.289219
- Title: Comparison of static and dynamic random forests models for EHR data in the presence of competing risks: predicting central line-associated bloodstream infection
- Title(参考訳): 競合リスクの存在下でのEHRデータに対する静的および動的ランダム森林モデルの比較:中央線関連血流感染の予測
- Authors: Elena Albu, Shan Gao, Pieter Stijnen, Frank Rademakers, Christel Janssens, Veerle Cossey, Yves Debaveye, Laure Wynants, Ben Van Calster,
- Abstract要約: 病院の入院に関する予後の結果は、一般的に検閲に苦しめられず、分類的にも時間的にもモデル化できる。
本研究は無作為林(RF)モデルを用いて中央線関連血液ストリーム感染症(CLABSI)の発症リスクを予測した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.202802833281752
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Prognostic outcomes related to hospital admissions typically do not suffer from censoring, and can be modeled either categorically or as time-to-event. Competing events are common but often ignored. We compared the performance of random forest (RF) models to predict the risk of central line-associated bloodstream infections (CLABSI) using different outcome operationalizations. We included data from 27478 admissions to the University Hospitals Leuven, covering 30862 catheter episodes (970 CLABSI, 1466 deaths and 28426 discharges) to build static and dynamic RF models for binary (CLABSI vs no CLABSI), multinomial (CLABSI, discharge, death or no event), survival (time to CLABSI) and competing risks (time to CLABSI, discharge or death) outcomes to predict the 7-day CLABSI risk. We evaluated model performance across 100 train/test splits. Performance of binary, multinomial and competing risks models was similar: AUROC was 0.74 for baseline predictions, rose to 0.78 for predictions at day 5 in the catheter episode, and decreased thereafter. Survival models overestimated the risk of CLABSI (E:O ratios between 1.2 and 1.6), and had AUROCs about 0.01 lower than other models. Binary and multinomial models had lowest computation times. Models including multiple outcome events (multinomial and competing risks) display a different internal structure compared to binary and survival models. In the absence of censoring, complex modelling choices do not considerably improve the predictive performance compared to a binary model for CLABSI prediction in our studied settings. Survival models censoring the competing events at their time of occurrence should be avoided.
- Abstract(参考訳): 病院の入院に関する予後の結果は、一般的に検閲に苦しめられず、分類的にも時間的にもモデル化できる。
競合イベントは一般的だが、しばしば無視される。
本研究は無作為林(RF)モデルを用いて中央線関連血液ストリーム感染症(CLABSI)の発症リスクを予測した。
27478例(CLABSI, 1466例, 28426例)を対象とし, 静的および動的RFモデルの構築(CLABSI vs. CLABSI), マルチノミアル(CLABSI, 退院, 退院, 退院, 退院), 生存(CLABSIまで), 競合リスク(CLABSIまでの時間, 退院, 退院), 7日間のCLABSIリスクの予測を行った。
列車/テストスプリット100回にわたってモデル性能を評価した。
AUROCはベースライン予測では0.74で、カテーテルエピソードでは5日目の予測では0.78まで上昇し、その後低下した。
生存モデルはCLABSI(E:O比1.2から1.6)のリスクを過大評価し、AUROCは他のモデルよりも約0.01低かった。
二項モデルと多項モデルでは計算時間が低かった。
複数の結果イベントを含むモデル(複数のリスクと競合するリスク)は、バイナリやサバイバルモデルとは異なる内部構造を示す。
検閲がない場合、複雑なモデリング選択はCLABSI予測のバイナリモデルと比較して予測性能を著しく改善しない。
発生時に競合するイベントを検閲する生存モデルは避けるべきである。
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