論文の概要: ACEGEN: Reinforcement learning of generative chemical agents for drug discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2405.04657v3
- Date: Mon, 22 Jul 2024 17:48:37 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-24 01:41:25.061709
- Title: ACEGEN: Reinforcement learning of generative chemical agents for drug discovery
- Title(参考訳): ACEGEN:医薬品発見のための生成化学物質の強化学習
- Authors: Albert Bou, Morgan Thomas, Sebastian Dittert, Carles Navarro Ramírez, Maciej Majewski, Ye Wang, Shivam Patel, Gary Tresadern, Mazen Ahmad, Vincent Moens, Woody Sherman, Simone Sciabola, Gianni De Fabritiis,
- Abstract要約: ACEGENは、創薬設計のための包括的で合理化されたツールキットである。
TorchRLは、完全にテストされた再利用可能なコンポーネントを提供する、現代的なRLライブラリである。
複数の薬物発見症例に応用されたACEGENの例を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.966722586536789
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In recent years, reinforcement learning (RL) has emerged as a valuable tool in drug design, offering the potential to propose and optimize molecules with desired properties. However, striking a balance between capabilities, flexibility, reliability, and efficiency remains challenging due to the complexity of advanced RL algorithms and the significant reliance on specialized code. In this work, we introduce ACEGEN, a comprehensive and streamlined toolkit tailored for generative drug design, built using TorchRL, a modern RL library that offers thoroughly tested reusable components. We validate ACEGEN by benchmarking against other published generative modeling algorithms and show comparable or improved performance. We also show examples of ACEGEN applied in multiple drug discovery case studies. ACEGEN is accessible at \url{https://github.com/acellera/acegen-open} and available for use under the MIT license.
- Abstract(参考訳): 近年、強化学習(RL)は医薬品設計において重要なツールとして登場し、望ましい性質を持つ分子の提案と最適化の可能性を秘めている。
しかし、高度なRLアルゴリズムの複雑さと特殊コードへのかなりの依存のため、能力、柔軟性、信頼性、効率のバランスを崩すことは依然として困難である。
そこで本研究では,既存のRLライブラリであるTorchRLを用いて構築した,創薬設計に適した包括的で合理化されたツールキットであるACEGENを紹介する。
我々は、ACEGENを他の生成的モデリングアルゴリズムと比較して検証し、同等または改善された性能を示す。
複数の薬物発見症例に応用されたACEGENの例も紹介する。
ACEGENは \url{https://github.com/acellera/acegen-open} でアクセスでき、MITライセンス下で利用できる。
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