論文の概要: G-Transformer: Counterfactual Outcome Prediction under Dynamic and Time-varying Treatment Regimes
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.05504v1
- Date: Sat, 8 Jun 2024 16:04:33 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-11 19:25:53.291090
- Title: G-Transformer: Counterfactual Outcome Prediction under Dynamic and Time-varying Treatment Regimes
- Title（参考訳）: G-transformer:動的および時間変化処理レジームにおける実測結果予測
- Authors: Hong Xiong, Feng Wu, Leon Deng, Megan Su, Li-wei H Lehman,
- Abstract要約: 本稿では,G-Transformerを提案する。G-Transformerは動的かつ時間的に異なる処理戦略の下で,対実予測のためのg-computationをサポートするフレームワークである。
メカニスティックモデルによる2つのシミュレーション時系列データセットとMIMIC-IVによる実世界のセシスICUデータセットを用いて,G-Transformerを広範囲に評価した。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 29.250837221920925
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In the context of medical decision making, counterfactual prediction enables clinicians to predict treatment outcomes of interest under alternative courses of therapeutic actions given observed patient history. Prior machine learning approaches for counterfactual predictions under time-varying treatments focus on static time-varying treatment regimes where treatments do not depend on previous covariate history. In this work, we present G-Transformer, a Transformer-based framework supporting g-computation for counterfactual prediction under dynamic and time-varying treatment strategies. G-Transfomer captures complex, long-range dependencies in time-varying covariates using a Transformer architecture. G-Transformer estimates the conditional distribution of relevant covariates given covariate and treatment history at each time point using an encoder architecture, then produces Monte Carlo estimates of counterfactual outcomes by simulating forward patient trajectories under treatment strategies of interest. We evaluate G-Transformer extensively using two simulated longitudinal datasets from mechanistic models, and a real-world sepsis ICU dataset from MIMIC-IV. G-Transformer outperforms both classical and state-of-the-art counterfactual prediction models in these settings. To the best of our knowledge, this is the first Transformer-based architecture for counterfactual outcome prediction under dynamic and time-varying treatment strategies. Code will be released upon publication of the paper.
- Abstract（参考訳）: 医学的意思決定の文脈では、反事実予測により、臨床医は、観察された患者の歴史に与えられた治療行動の代替コースの下で、興味のある治療結果を予測することができる。
従来の機械学習アプローチは、過去の共変量履歴に依存しない静的な時間変化治療体制に重点を置いている。
本稿では,G-Transformerについて述べる。G-Transformerは動的および時間的処理戦略の下での対実予測のためのg-computationをサポートするトランスフォーマーベースのフレームワークである。
G-Transfomerは、Transformerアーキテクチャを用いて、時間変化の共変量における複雑な長距離依存関係をキャプチャする。
G-Transformerは、エンコーダアーキテクチャを用いて、各時点における関連共変量および処理履歴の条件分布を推定し、興味ある治療戦略の下で患者軌道をシミュレートすることで、偽結果のモンテカルロ推定を生成する。
メカニスティックモデルによる2つのシミュレーション時系列データセットとMIMIC-IVによる実世界のセシスICUデータセットを用いて,G-Transformerを広範囲に評価した。
G-Transformerは、これらの設定において、古典的および最先端の対実予測モデルの両方を上回っている。
我々の知る限り、このアーキテクチャは動的かつ時間的に変化する治療戦略の下で、対実的な結果予測を行う最初のTransformerベースのアーキテクチャである。
コードは論文の発行時に公開される。
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