論文の概要: Self-supervised Brain Lesion Generation for Effective Data Augmentation of Medical Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.14826v1
- Date: Fri, 21 Jun 2024 01:53:12 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-24 15:02:37.064185
- Title: Self-supervised Brain Lesion Generation for Effective Data Augmentation of Medical Images
- Title(参考訳): 医用画像の効果的なデータ拡張のための自己監督型脳病変生成
- Authors: Jiayu Huo, Sebastien Ourselin, Rachel Sparks,
- Abstract要約: 本稿では,脳病変分割モデルのトレーニングのための,新しい現実的なサンプルを効率よく生成するフレームワークを提案する。
まず, 対向型自己エンコーダに基づく病変発生器を自己管理的に訓練する。
次に,新しい画像合成アルゴリズムであるSoft Poisson Blendingを用いて,合成病変と脳画像のシームレスな結合を行う。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.9626666671366836
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Accurate brain lesion delineation is important for planning neurosurgical treatment. Automatic brain lesion segmentation methods based on convolutional neural networks have demonstrated remarkable performance. However, neural network performance is constrained by the lack of large-scale well-annotated training datasets. In this manuscript, we propose a comprehensive framework to efficiently generate new, realistic samples for training a brain lesion segmentation model. We first train a lesion generator, based on an adversarial autoencoder, in a self-supervised manner. Next, we utilize a novel image composition algorithm, Soft Poisson Blending, to seamlessly combine synthetic lesions and brain images to obtain training samples. Finally, to effectively train the brain lesion segmentation model with augmented images we introduce a new prototype consistence regularization to align real and synthetic features. Our framework is validated by extensive experiments on two public brain lesion segmentation datasets: ATLAS v2.0 and Shift MS. Our method outperforms existing brain image data augmentation schemes. For instance, our method improves the Dice from 50.36% to 60.23% compared to the U-Net with conventional data augmentation techniques for the ATLAS v2.0 dataset.
- Abstract(参考訳): 正確な脳病変の脱線は神経外科治療の計画に重要である。
畳み込みニューラルネットワークに基づく自動脳病変分割法は顕著な性能を示した。
しかしながら、ニューラルネットワークのパフォーマンスは、大規模に注釈付けされたトレーニングデータセットの欠如によって制限されている。
そこで本論文では,脳病変セグメンテーションモデルをトレーニングするための,新しい現実的なサンプルを効率的に生成するための包括的枠組みを提案する。
まず, 対向型自己エンコーダに基づく病変発生器を自己管理的に訓練する。
次に、新しい画像合成アルゴリズムであるSoft Poisson Blendingを用いて、合成病変と脳画像をシームレスに組み合わせてトレーニングサンプルを得る。
最後に,脳病変セグメンテーションモデルを拡張画像で効果的に訓練するために,実像と合成像を整列させるための新しいプロトタイプを導入する。
我々のフレームワークは、ATLAS v2.0とShift MSの2つのパブリック脳病変セグメンテーションデータセットに関する広範な実験によって検証されている。
例えば、我々の方法では、従来のATLAS v2.0データセットのデータ拡張技術を用いて、U-Netと比較して、Diceを50.36%から60.23%に改善する。
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