論文の概要: Automated Immunophenotyping Assessment for Diagnosing Childhood Acute Leukemia using Set-Transformers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.18309v1
- Date: Wed, 26 Jun 2024 12:50:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-27 13:29:21.768027
- Title: Automated Immunophenotyping Assessment for Diagnosing Childhood Acute Leukemia using Set-Transformers
- Title(参考訳): 小児急性白血病診断のためのセットトランスフォーマーを用いた自動免疫フェノタイピング評価
- Authors: Elpiniki Maria Lygizou, Michael Reiter, Margarita Maurer-Granofszky, Michael Dworzak, Radu Grosu,
- Abstract要約: 本稿では,小児急性白血病における免疫フェノタイピング評価の自動化を目的として,機械学習による自己注意型FCM診断ツールであるFCM-Formerを提案する。
急性B細胞, T細胞リンパ芽球性, 急性骨髄性白血病(B-ALL, T-ALL, AML)の960例において, FCM-Formerは96.5%の精度でそれぞれの標本に系統を割り当てている。
我々の知る限り、FCM-Formerは小児急性白血病の診断において、FCMデータによる免疫フェノタイピング評価を自動化する最初の研究である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.128460923508468
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Acute Leukemia is the most common hematologic malignancy in children and adolescents. A key methodology in the diagnostic evaluation of this malignancy is immunophenotyping based on Multiparameter Flow Cytometry (FCM). However, this approach is manual, and thus time-consuming and subjective. To alleviate this situation, we propose in this paper the FCM-Former, a machine learning, self-attention based FCM-diagnostic tool, automating the immunophenotyping assessment in Childhood Acute Leukemia. The FCM-Former is trained in a supervised manner, by directly using flow cytometric data. Our FCM-Former achieves an accuracy of 96.5% assigning lineage to each sample among 960 cases of either acute B-cell, T-cell lymphoblastic, and acute myeloid leukemia (B-ALL, T-ALL, AML). To the best of our knowledge, the FCM-Former is the first work that automates the immunophenotyping assessment with FCM data in diagnosing pediatric Acute Leukemia.
- Abstract(参考訳): 急性白血病は小児や青年期で最も一般的な血液悪性腫瘍である。
この悪性度を診断するための重要な手法は、多パラメータフローサイトメトリー(FCM)に基づく免疫フェノタイピングである。
しかし、このアプローチは手作業であり、そのため時間がかかり、主観的です。
本論文では,小児急性白血病における免疫フェノタイピング評価を自動化する機械学習・自己注意型FCM診断ツールであるFCM-Formerを提案する。
FCM-Formerは、フローサイトメトリーデータを直接使用することにより、教師付きで訓練される。
急性B細胞,T細胞リンパ芽球性白血病,急性骨髄性白血病(B-ALL,T-ALL,AML)の960例において,FCM-Formerは96.5%の精度でそれぞれの標本に系統を割り当てた。
我々の知る限り、FCM-Formerは小児急性白血病の診断において、FCMデータによる免疫フェノタイピング評価を自動化する最初の研究である。
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