論文の概要: Deep Learning Based Apparent Diffusion Coefficient Map Generation1 from Multi-parametric MR Images for Patients with Diffuse Gliomas
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.02616v1
- Date: Tue, 2 Jul 2024 19:08:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-04 18:24:13.176654
- Title: Deep Learning Based Apparent Diffusion Coefficient Map Generation1 from Multi-parametric MR Images for Patients with Diffuse Gliomas
- Title(参考訳): びまん性グリオーマに対する多パラメータMR画像からの深層学習に基づくApparent Diffusion Coefficient Map Generation1
- Authors: Zach Eidex, Mojtaba Safari, Jacob Wynne, Richard L. J. Qiu, Tonghe Wang, David Viar Hernandez, Hui-Kuo Shu, Hui Mao, Xiaofeng Yang,
- Abstract要約: 拡散強調(DWI)MRIから得られたADCマップは、組織内の水分子に関する機能的測定を提供する。
本研究では,多パラメータMR画像からADCマップを合成するディープラーニングフレームワークを開発することを目的とする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.5267759610392577
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Purpose: Apparent diffusion coefficient (ADC) maps derived from diffusion weighted (DWI) MRI provides functional measurements about the water molecules in tissues. However, DWI is time consuming and very susceptible to image artifacts, leading to inaccurate ADC measurements. This study aims to develop a deep learning framework to synthesize ADC maps from multi-parametric MR images. Methods: We proposed the multiparametric residual vision transformer model (MPR-ViT) that leverages the long-range context of ViT layers along with the precision of convolutional operators. Residual blocks throughout the network significantly increasing the representational power of the model. The MPR-ViT model was applied to T1w and T2- fluid attenuated inversion recovery images of 501 glioma cases from a publicly available dataset including preprocessed ADC maps. Selected patients were divided into training (N=400), validation (N=50) and test (N=51) sets, respectively. Using the preprocessed ADC maps as ground truth, model performance was evaluated and compared against the Vision Convolutional Transformer (VCT) and residual vision transformer (ResViT) models. Results: The results are as follows using T1w + T2-FLAIR MRI as inputs: MPR-ViT - PSNR: 31.0 +/- 2.1, MSE: 0.009 +/- 0.0005, SSIM: 0.950 +/- 0.015. In addition, ablation studies showed the relative impact on performance of each input sequence. Both qualitative and quantitative results indicate that the proposed MR- ViT model performs favorably against the ground truth data. Conclusion: We show that high-quality ADC maps can be synthesized from structural MRI using a MPR- VCT model. Our predicted images show better conformality to the ground truth volume than ResViT and VCT predictions. These high-quality synthetic ADC maps would be particularly useful for disease diagnosis and intervention, especially when ADC maps have artifacts or are unavailable.
- Abstract(参考訳): 目的:拡散強調(DWI)MRIから得られたADCマップは組織中の水分子に関する機能的測定を提供する。
しかし、DWIは時間がかかり、画像のアーティファクトに非常に影響を受けやすいため、不正確なADC測定に繋がる。
本研究では,多パラメータMR画像からADCマップを合成するディープラーニングフレームワークを開発することを目的とする。
方法: 畳み込み演算子の精度とともに、ViT層の長距離コンテキストを利用するマルチパラメトリック残差視覚変換器モデル(MPR-ViT)を提案する。
ネットワーク全体の残差ブロックは、モデルの表現力を大幅に増大させた。
The MPR-ViT model applied to T1w and T2- fluid attenuated inversion recovery image of 501 glioma case from a public available dataset including preprocessed ADC map。
選択した患者はトレーニング(N=400),バリデーション(N=50),テスト(N=51)に分けた。
事前処理したADCマップを根拠として、モデル性能を評価し、Vision Convolutional Transformer (VCT) モデルとResViT (ResViT) モデルと比較した。
MPR-ViT - PSNR: 31.0 +/- 2.1, MSE: 0.009 +/- 0.0005, SSIM: 0.950 +/- 0.015。
さらに,アブレーション実験では,各入力シーケンスの性能に相対的な影響が認められた。
定性的および定量的な結果は,提案したMR-ViTモデルが真理データに対して良好に動作することを示す。
結論: MPR-VCT モデルを用いて構造MRI から高品質な ADC マップを合成できることが示唆された。
我々の予測画像は、ResViTやVCTの予測よりも、地上の真理量との整合性が高い。
これらの高品質の合成ADCマップは、病気の診断や介入に特に有用であり、特にADCマップがアーティファクトを持っているか、利用できない場合に有用である。
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