論文の概要: Meta-Learning on Augmented Gene Expression Profiles for Enhanced Lung Cancer Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.09635v1
- Date: Mon, 19 Aug 2024 01:39:12 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-20 17:53:49.685033
- Title: Meta-Learning on Augmented Gene Expression Profiles for Enhanced Lung Cancer Detection
- Title(参考訳): 肺癌検診における遺伝子発現プロファイルのメタラーニング
- Authors: Arya Hadizadeh Moghaddam, Mohsen Nayebi Kerdabadi, Cuncong Zhong, Zijun Yao,
- Abstract要約: 本稿では,遺伝子発現プロファイルから肺がんを予測するためのメタラーニングに基づくアプローチを提案する。
メタ学習タスクには4つの異なるデータセットを使用します。
その結果、単一のデータセットでトレーニングされたベースラインと比較して、強化されたソースデータに対するメタラーニングの優れた性能を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.7929238927240685
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Gene expression profiles obtained through DNA microarray have proven successful in providing critical information for cancer detection classifiers. However, the limited number of samples in these datasets poses a challenge to employ complex methodologies such as deep neural networks for sophisticated analysis. To address this "small data" dilemma, Meta-Learning has been introduced as a solution to enhance the optimization of machine learning models by utilizing similar datasets, thereby facilitating a quicker adaptation to target datasets without the requirement of sufficient samples. In this study, we present a meta-learning-based approach for predicting lung cancer from gene expression profiles. We apply this framework to well-established deep learning methodologies and employ four distinct datasets for the meta-learning tasks, where one as the target dataset and the rest as source datasets. Our approach is evaluated against both traditional and deep learning methodologies, and the results show the superior performance of meta-learning on augmented source data compared to the baselines trained on single datasets. Moreover, we conduct the comparative analysis between meta-learning and transfer learning methodologies to highlight the efficiency of the proposed approach in addressing the challenges associated with limited sample sizes. Finally, we incorporate the explainability study to illustrate the distinctiveness of decisions made by meta-learning.
- Abstract(参考訳): DNAマイクロアレイで得られた遺伝子発現プロファイルは、がん検出分類器に重要な情報を提供するのに成功している。
しかし、これらのデータセットの限られた数のサンプルは、高度な分析のためにディープニューラルネットワークのような複雑な方法論を採用することを困難にしている。
この"小さなデータ"ジレンマに対処するため、Meta-Learningは、類似したデータセットを利用することで、機械学習モデルの最適化を強化するソリューションとして導入され、十分なサンプルを必要とせずに、ターゲットデータセットへの迅速な適応が容易になった。
本研究では,遺伝子プロファイルから肺がんを予測するメタラーニングに基づくアプローチを提案する。
このフレームワークを確立されたディープラーニング手法に適用し、メタ学習タスクに4つの異なるデータセットを使用します。
提案手法は,従来の学習手法と深層学習法の両方に対して評価され,その結果,単一のデータセットでトレーニングしたベースラインと比較して,拡張ソースデータ上でのメタラーニングの優れた性能を示した。
さらに,メタラーニング手法とトランスファーラーニング手法の比較分析を行い,限られたサンプルサイズにかかわる課題に対処する上で,提案手法の効率性を強調した。
最後に,メタラーニングによる決定の特異性を説明するために,説明可能性研究を取り入れた。
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