論文の概要: From Glucose Patterns to Health Outcomes: A Generalizable Foundation Model for Continuous Glucose Monitor Data Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.11876v2
- Date: Tue, 07 Jan 2025 16:01:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-08 15:47:56.736932
- Title: From Glucose Patterns to Health Outcomes: A Generalizable Foundation Model for Continuous Glucose Monitor Data Analysis
- Title(参考訳): グルコースパターンから健康結果へ:連続グルコースモニターデータ解析のための一般化可能な基礎モデル
- Authors: Guy Lutsker, Gal Sapir, Smadar Shilo, Jordi Merino, Anastasia Godneva, Jerry R Greenfield, Dorit Samocha-Bonet, Raja Dhir, Francisco Gude, Shie Mannor, Eli Meirom, Gal Chechik, Hagai Rossman, Eran Segal,
- Abstract要約: 本稿では,CGMデータの生成基盤モデルであるGluFormerについて紹介する。
GluFormerは、異なる民族や年齢、5つの国、8つのCGMデバイス、多様な病態状態にまたがる19の外部コホートに一般化する。
CGMデータと12年間のフォローアップを持つ580人の成人の縦断的研究において、GluFormerは血液HbA1C%よりも糖尿病を効果的に発症するリスクが高い個人を特定する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 47.23780364438969
- License:
- Abstract: Recent advances in SSL enabled novel medical AI models, known as foundation models, offer great potential for better characterizing health from diverse biomedical data. CGM provides rich, temporal data on glycemic patterns, but its full potential for predicting broader health outcomes remains underutilized. Here, we present GluFormer, a generative foundation model for CGM data that learns nuanced glycemic patterns and translates them into predictive representations of metabolic health. Trained on over 10 million CGM measurements from 10,812 adults, primarily without diabetes, GluFormer uses autoregressive token prediction to capture longitudinal glucose dynamics. We show that GluFormer generalizes to 19 external cohorts (n=6,044) spanning different ethnicities and ages, 5 countries, 8 CGM devices, and diverse pathophysiological states. GluFormers representations exceed the performance of current CGM metrics, such as the Glucose Management Indicator (GMI), for forecasting clinical measures. In a longitudinal study of 580 adults with CGM data and 12-year follow-up, GluFormer identifies individuals at elevated risk of developing diabetes more effectively than blood HbA1C%, capturing 66% of all new-onset diabetes diagnoses in the top quartile versus 7% in the bottom quartile. Similarly, 69% of cardiovascular-death events occurred in the top quartile with none in the bottom quartile, demonstrating powerful risk stratification beyond traditional glycemic metrics. We also show that CGM representations from pre-intervention periods in Randomized Clinical Trials outperform other methods in predicting primary and secondary outcomes. When integrating dietary data into GluFormer, we show that the multi-modal version of the model can accurately generate CGM data based on dietary intake data, simulate outcomes of dietary interventions, and predict individual responses to specific foods.
- Abstract(参考訳): SSLの最近の進歩は、ファンデーションモデルとして知られる新しい医療AIモデルを可能にし、多様なバイオメディカルデータから健康を特徴づける大きな可能性を秘めている。
CGMは、血糖パターンに関する豊富な時間的データを提供するが、より広範な健康結果を予測するための大きな可能性はまだ未利用である。
本稿では,CGMデータの生成基盤モデルであるGluFormerについて述べる。
糖尿病のない成人10,812人のCGMを1000万回以上測定したGluFormerは、自己回帰トークン予測を使って、縦方向のグルコース動態を捉えている。
GluFormer は19の外部コホート (n=6,044) を、異なる民族や年齢、5つの国、8つのCGMデバイス、多様な病態状態に一般化している。
GluFormersの表現は、Glucose Management Indicator (GMI) のような現在のCGMメトリクスのパフォーマンスを上回る。
580人の成人のCGMデータと12年間の追跡調査において、GluFormerは血液HbA1C%よりも効果的に糖尿病を発症するリスクが高く、上四肢の新規発症糖尿病の66%を、下四肢の7%と比較した。
同様に、心血管死の69%は、最上部の四面体で発生し、底の四面体には誰も存在せず、従来の血糖値を超える強力なリスク階層化が見られた。
また, ランダム化臨床試験における介入前期間のCGM表現は, 一次および二次結果を予測する他の方法よりも優れていた。
GluFormerに食事データを統合すると、このモデルのマルチモーダルバージョンは、食事摂取データに基づいてCGMデータを正確に生成し、食事介入の結果をシミュレートし、特定の食品に対する個々の反応を予測することができることを示す。
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