論文の概要: Leveraging Persistent Homology for Differential Diagnosis of Mild Cognitive Impairment
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.15647v1
- Date: Wed, 28 Aug 2024 09:01:55 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-29 16:43:13.055825
- Title: Leveraging Persistent Homology for Differential Diagnosis of Mild Cognitive Impairment
- Title(参考訳): 軽度認知障害の鑑別診断における Persistent Homology の活用
- Authors: Ninad Aithal, Debanjali Bhattacharya, Neelam Sinha, Thomas Gregor Issac,
- Abstract要約: 軽度認知障害(MCI)は、認知機能の微妙な変化が特徴であり、しばしば脳の接続の混乱と関連している。
本研究では,6種類の被験者の脳ネットワークに関連する神経変性のトポロジカルな変化を調べるための,新しい微粒化分析法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.474908349649168
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Mild cognitive impairment (MCI) is characterized by subtle changes in cognitive functions, often associated with disruptions in brain connectivity. The present study introduces a novel fine-grained analysis to examine topological alterations in neurodegeneration pertaining to six different brain networks of MCI subjects (Early/Late MCI). To achieve this, fMRI time series from two distinct populations are investigated: (i) the publicly accessible ADNI dataset and (ii) our in-house dataset. The study utilizes sliding window embedding to convert each fMRI time series into a sequence of 3-dimensional vectors, facilitating the assessment of changes in regional brain topology. Distinct persistence diagrams are computed for Betti descriptors of dimension-0, 1, and 2. Wasserstein distance metric is used to quantify differences in topological characteristics. We have examined both (i) ROI-specific inter-subject interactions and (ii) subject-specific inter-ROI interactions. Further, a new deep learning model is proposed for classification, achieving a maximum classification accuracy of 95% for the ADNI dataset and 85% for the in-house dataset. This methodology is further adapted for the differential diagnosis of MCI sub-types, resulting in a peak accuracy of 76.5%, 91.1% and 80% in classifying HC Vs. EMCI, HC Vs. LMCI and EMCI Vs. LMCI, respectively. We showed that the proposed approach surpasses current state-of-the-art techniques designed for classifying MCI and its sub-types using fMRI.
- Abstract(参考訳): 軽度認知障害(MCI)は、認知機能の微妙な変化が特徴であり、しばしば脳の接続の混乱と関連している。
本研究は、MCI被験者の6つの異なる脳ネットワーク(Early/Late MCI)に関連する神経変性のトポロジカルな変化を調べるための、新しいきめ細かい分析法を提案する。
これを実現するために、2つの異なる集団のfMRI時系列を調査した。
i)パブリックアクセス可能なADNIデータセット及び
(ii) 社内データセット。
この研究は、スライディングウィンドウの埋め込みを利用して、各fMRI時系列を3次元ベクトル列に変換することで、局所脳トポロジーの変化を評価する。
次元 0, 1, 2 のベティ記述子に対しては、離散永続図式が計算される。
ワッサーシュタイン距離計量は、位相特性の違いを定量化するために用いられる。
私たちは両方を調べました
一 ROI固有の物体間相互作用及び相互作用
(II)主観的ROI間相互作用。
さらに,新たなディープラーニングモデルが提案され,ADNIデータセットの95%,社内データセットの85%の最大分類精度が達成された。
この手法は、MCIサブタイプの鑑別診断にも適用され、それぞれHC Vs. EMCI、HC Vs. LMCI、EMCI Vs. LMCIの分類におけるピーク精度は76.5%、91.1%、80%となる。
提案手法は,fMRIを用いてMCIとそのサブタイプを分類するための最先端技術を上回ることを示した。
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