論文の概要: Neural P$^3$M: A Long-Range Interaction Modeling Enhancer for Geometric
GNNs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.17622v1
- Date: Thu, 26 Sep 2024 08:16:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-28 21:53:57.546902
- Title: Neural P$^3$M: A Long-Range Interaction Modeling Enhancer for Geometric
GNNs
- Title(参考訳): ニューラルP$3$M:幾何学のための長距離相互作用モデリングエンハンサー
GNN
- Authors: Yusong Wang, Chaoran Cheng, Shaoning Li, Yuxuan Ren, Bin Shao, Ge Liu,
Pheng-Ann Heng, Nanning Zheng
- Abstract要約: 我々は,幾何学的GNNの汎用エンハンサーであるNeural P$3$Mを導入し,その機能範囲を拡大する。
幅広い分子系に柔軟性を示し、エネルギーと力を予測する際、顕著な精度を示す。
また、さまざまなアーキテクチャを統合しながら、OE62データセットで平均22%の改善も達成している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 66.98487644676906
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Geometric graph neural networks (GNNs) have emerged as powerful tools for
modeling molecular geometry. However, they encounter limitations in effectively
capturing long-range interactions in large molecular systems. To address this
challenge, we introduce Neural P$^3$M, a versatile enhancer of geometric GNNs
to expand the scope of their capabilities by incorporating mesh points
alongside atoms and reimaging traditional mathematical operations in a
trainable manner. Neural P$^3$M exhibits flexibility across a wide range of
molecular systems and demonstrates remarkable accuracy in predicting energies
and forces, outperforming on benchmarks such as the MD22 dataset. It also
achieves an average improvement of 22% on the OE62 dataset while integrating
with various architectures.
- Abstract(参考訳): 幾何学グラフニューラルネットワーク(GNN)は、分子幾何学をモデル化するための強力なツールとして登場した。
しかし、それらは大きな分子系における長距離相互作用を効果的に捉えるのに限界に遭遇する。
この課題に対処するために、我々は、原子とメッシュポイントを組み込んだり、伝統的な数学的操作をトレーニング可能な方法で再現することによって、それらの能力の範囲を広げるために、幾何的GNNの汎用エンハンサーであるNeural P$3$Mを導入する。
ニューラルP$3$Mは、幅広い分子系にわたる柔軟性を示し、エネルギーと力の予測において顕著な精度を示し、MD22データセットのようなベンチマークでより優れている。
また、さまざまなアーキテクチャを統合しながら、OE62データセットで平均22%の改善も達成している。
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