論文の概要: CoTCoNet: An Optimized Coupled Transformer-Convolutional Network with an Adaptive Graph Reconstruction for Leukemia Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.08797v2
- Date: Mon, 21 Oct 2024 15:45:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-10-30 21:55:58.058058
- Title: CoTCoNet: An Optimized Coupled Transformer-Convolutional Network with an Adaptive Graph Reconstruction for Leukemia Detection
- Title(参考訳): CoTCoNet: 白血病検出のための適応的グラフ再構成を用いた最適結合型トランスフォーマー・コンボリューションネットワーク
- Authors: Chandravardhan Singh Raghaw, Arnav Sharma, Shubhi Bansal, Mohammad Zia Ur Rehman, Nagendra Kumar,
- Abstract要約: 白血病の分類のためのCoTCoNet(Coupled Transformer Convolutional Network)フレームワークを提案する。
我々のフレームワークは、包括的グローバル特徴とスケーラブルな空間パターンを捉え、複雑で大規模な血液学的特徴の同定を可能にする。
それぞれ0.9894と0.9893のF1スコアレートを達成している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.3573481101204926
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Swift and accurate blood smear analysis is an effective diagnostic method for leukemia and other hematological malignancies. However, manual leukocyte count and morphological evaluation using a microscope is time-consuming and prone to errors. Conventional image processing methods also exhibit limitations in differentiating cells due to the visual similarity between malignant and benign cell morphology. This limitation is further compounded by the skewed training data that hinders the extraction of reliable and pertinent features. In response to these challenges, we propose an optimized Coupled Transformer Convolutional Network (CoTCoNet) framework for the classification of leukemia, which employs a well-designed transformer integrated with a deep convolutional network to effectively capture comprehensive global features and scalable spatial patterns, enabling the identification of complex and large-scale hematological features. Further, the framework incorporates a graph-based feature reconstruction module to reveal the hidden or unobserved hard-to-see biological features of leukocyte cells and employs a Population-based Meta-Heuristic Algorithm for feature selection and optimization. To mitigate data imbalance issues, we employ a synthetic leukocyte generator. In the evaluation phase, we initially assess CoTCoNet on a dataset containing 16,982 annotated cells, and it achieves remarkable accuracy and F1-Score rates of 0.9894 and 0.9893, respectively. To broaden the generalizability of our model, we evaluate it across four publicly available diverse datasets, which include the aforementioned dataset. This evaluation demonstrates that our method outperforms current state-of-the-art approaches. We also incorporate an explainability approach in the form of feature visualization closely aligned with cell annotations to provide a deeper understanding of the framework.
- Abstract(参考訳): スイフトと正確な血液スミア分析は、白血病やその他の血液悪性腫瘍の効果的な診断方法である。
しかし, 顕微鏡を用いた手動白血球数と形態評価は時間を要するため, エラーが生じる傾向がみられた。
従来の画像処理手法は、悪性細胞と良性細胞の形態の視覚的類似性による細胞分化の限界も示している。
この制限は、信頼性と関連する特徴の抽出を妨げる歪んだトレーニングデータによってさらに複雑にされる。
これらの課題に対応するため、我々は、深層畳み込みネットワークと統合されたよく設計されたトランスフォーマーを用いて、包括的グローバル特徴と拡張性のある空間パターンを効果的にキャプチャし、複雑で大規模な血液学的特徴の同定を可能にする、白血病の分類のための最適化されたCoTCoNet(CoTCoNet)フレームワークを提案する。
さらに、このフレームワークは、グラフベースの機能再構成モジュールを組み込んで、白血球細胞の隠れた、または観察できない生物学的特徴を明らかにするとともに、機能選択と最適化のために、Populationベースのメタヒューリスティックアルゴリズムを使用している。
データ不均衡を緩和するために、我々は合成白血球生成装置を用いる。
評価段階では16,982個のアノテートされたセルを含むデータセット上でCoTCoNetを評価し,それぞれ0.9894と0.9893のF1スコアレートを達成した。
モデルの一般化性を高めるため、上記のデータセットを含む4つの公開可能な多種多様なデータセットにまたがって評価を行った。
この評価は,本手法が現在の最先端手法よりも優れていることを示す。
また,機能可視化をセルアノテーションと密に整合させて,フレームワークをより深く理解するための説明可能性アプローチも取り入れた。
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