論文の概要: Foundation Models for Slide-level Cancer Subtyping in Digital Pathology

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.15886v1
• Date: Mon, 21 Oct 2024 11:04:58 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2024-10-22 13:18:29.288409
• Title: Foundation Models for Slide-level Cancer Subtyping in Digital Pathology
• Title（参考訳）: デジタル病理学におけるスライドレベル癌サブタイピングの基礎モデル
• Authors: Pablo Meseguer, Rocío del Amor, Adrian Colomer, Valery Naranjo,
• Abstract要約: 本研究の目的は,MIL フレームワークを用いて,WSI 上の癌サブタイプのための事前訓練戦略に基づいて開発された様々な特徴抽出器の性能を比較することである。 その結果、6種類の皮膚がんの亜型を予測するために、イメージネットが事前訓練したモデルを超える基礎モデルの有効性が示された。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 1.7641392161755438
• License:
• Abstract: Since the emergence of the ImageNet dataset, the pretraining and fine-tuning approach has become widely adopted in computer vision due to the ability of ImageNet-pretrained models to learn a wide variety of visual features. However, a significant challenge arises when adapting these models to domain-specific fields, such as digital pathology, due to substantial gaps between domains. To address this limitation, foundation models (FM) have been trained on large-scale in-domain datasets to learn the intricate features of histopathology images. In cancer diagnosis, whole-slide image (WSI) prediction is essential for patient prognosis, and multiple instance learning (MIL) has been implemented to handle the giga-pixel size of WSI. As MIL frameworks rely on patch-level feature aggregation, this work aims to compare the performance of various feature extractors developed under different pretraining strategies for cancer subtyping on WSI under a MIL framework. Results demonstrate the ability of foundation models to surpass ImageNet-pretrained models for the prediction of six skin cancer subtypes
• Abstract（参考訳）: ImageNetデータセットの出現以来、ImageNet事前学習モデルが様々な視覚的特徴を学習できるため、コンピュータビジョンにおいて事前学習と微調整のアプローチが広く採用されている。 しかし、ドメイン間の大きなギャップのために、デジタル病理のようなドメイン固有の分野にこれらのモデルを適用する際には、大きな課題が生じる。 この制限に対処するため、ファンデーションモデル(FM)は大規模なドメイン内データセットを用いて、病理像の複雑な特徴を学習するために訓練されている。 がん診断では,患者の予後には全スライディング画像(WSI)の予測が不可欠であり,WSIのギガピクセルサイズを扱うためにマルチインスタンスラーニング(MIL)が実施されている。 MILフレームワークはパッチレベルの機能アグリゲーションに依存しているため、MILフレームワークの下でWSIをサブタイプするための様々な事前訓練戦略の下で開発された様々な特徴抽出器の性能を比較することを目的としている。 結果は、6種類の皮膚癌サブタイプ予測のためのイメージネット事前学習モデルを超える基礎モデルの有効性を示す。

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