論文の概要: A scalable generative model for dynamical system reconstruction from neuroimaging data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.02949v1
- Date: Tue, 05 Nov 2024 09:45:57 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-06 14:58:08.400077
- Title: A scalable generative model for dynamical system reconstruction from neuroimaging data
- Title(参考訳): ニューロイメージングデータを用いた動的システム再構築のためのスケーラブルな生成モデル
- Authors: Eric Volkmann, Alena Brändle, Daniel Durstewitz, Georgia Koppe,
- Abstract要約: データ駆動推論は、観測された時系列の集合に基づく生成力学の推論であり、機械学習への関心が高まっている。
動的システム再構成(DSR)に特化した状態空間モデル(SSM)のトレーニング技術における最近の進歩は、基礎となるシステムの回復を可能にする。
本稿では,この問題を解く新しいアルゴリズムを提案し,モデル次元とフィルタ長とを比較検討する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.777167013394619
- License:
- Abstract: Data-driven inference of the generative dynamics underlying a set of observed time series is of growing interest in machine learning and the natural sciences. In neuroscience, such methods promise to alleviate the need to handcraft models based on biophysical principles and allow to automatize the inference of inter-individual differences in brain dynamics. Recent breakthroughs in training techniques for state space models (SSMs) specifically geared toward dynamical systems (DS) reconstruction (DSR) enable to recover the underlying system including its geometrical (attractor) and long-term statistical invariants from even short time series. These techniques are based on control-theoretic ideas, like modern variants of teacher forcing (TF), to ensure stable loss gradient propagation while training. However, as it currently stands, these techniques are not directly applicable to data modalities where current observations depend on an entire history of previous states due to a signal's filtering properties, as common in neuroscience (and physiology more generally). Prominent examples are the blood oxygenation level dependent (BOLD) signal in functional magnetic resonance imaging (fMRI) or Ca$^{2+}$ imaging data. Such types of signals render the SSM's decoder model non-invertible, a requirement for previous TF-based methods. Here, exploiting the recent success of control techniques for training SSMs, we propose a novel algorithm that solves this problem and scales exceptionally well with model dimensionality and filter length. We demonstrate its efficiency in reconstructing dynamical systems, including their state space geometry and long-term temporal properties, from just short BOLD time series.
- Abstract(参考訳): データ駆動推論は、観測された時系列の集合に基づく生成力学の推論であり、機械学習や自然科学への関心が高まっている。
神経科学において、そのような方法は、生体物理学の原理に基づく手技モデルの必要性を緩和し、脳力学における個人間差異の推論を自動化することを約束する。
状態空間モデル(SSM)のトレーニング技術における最近の進歩は、動的システム(DS)再構成(DSR)に特化して、幾何学的(トラクター)や長期統計不変量を含む基礎システムを、たとえ短い時系列から復元することができる。
これらの手法は、教師強制の現代の変種(TF)のような制御理論に基づくもので、訓練中に安定した損失勾配の伝播を保証する。
しかし、現状では、これらの手法は、信号のフィルタリング特性が、神経科学(およびより一般的には生理学)に共通しているため、現在の観測が以前の状態の全履歴に依存しているデータモダリティに直接適用されない。
代表的な例として、機能的磁気共鳴画像(fMRI)における血液酸素濃度依存性(BOLD)信号や、Ca$^{2+}$イメージングデータがある。
このような信号はSSMのデコーダモデルを非可逆的に表現する。
そこで本研究では,近年のSSMの学習における制御技術の成功を生かして,この問題を解き,モデル次元とフィルタ長に比例してスケールする新しいアルゴリズムを提案する。
短時間のBOLD時系列から状態空間幾何や長期時間特性を含む力学系を再構築する際の効率を実証する。
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