論文の概要: Entropy Bootstrapping for Weakly Supervised Nuclei Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.13528v1
- Date: Wed, 20 Nov 2024 18:24:11 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-21 16:13:06.399780
- Title: Entropy Bootstrapping for Weakly Supervised Nuclei Detection
- Title(参考訳): 弱教師付き核検出のためのエントロピーブートストラップ
- Authors: James Willoughby, Irina Voiculescu,
- Abstract要約: エントロピー推定には点ラベルを用いて,基礎となるセルピクセルの分布を近似する。
この分布から全セルマスクを推定し,Mask-RCNNを用いてインスタンス分割出力を生成する。
本手法は,95%の画素ラベルの削減にもかかわらず,比較的良好な性能が得られることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.125790742633738
- License:
- Abstract: Microscopy structure segmentation, such as detecting cells or nuclei, generally requires a human to draw a ground truth contour around each instance. Weakly supervised approaches (e.g. consisting of only single point labels) have the potential to reduce this workload significantly. Our approach uses individual point labels for an entropy estimation to approximate an underlying distribution of cell pixels. We infer full cell masks from this distribution, and use Mask-RCNN to produce an instance segmentation output. We compare this point--annotated approach with training on the full ground truth masks. We show that our method achieves a comparatively good level of performance, despite a 95% reduction in pixel labels.
- Abstract(参考訳): 細胞や核を検知するなどの顕微鏡構造セグメンテーションは、通常、人間が各インスタンスの周りに真実の輪郭を描く必要がある。
弱教師付きアプローチ(例:単一点ラベルのみからなる)は、このワークロードを大幅に削減する可能性がある。
提案手法では,個々の点ラベルを用いてエントロピー推定を行い,基礎となるセルピクセルの分布を近似する。
この分布から全セルマスクを推定し,Mask-RCNNを用いてインスタンス分割出力を生成する。
我々は、この点を注釈付けしたアプローチと、フルグランドの真理マスクのトレーニングを比較した。
本手法は,95%の画素ラベルの削減にもかかわらず,比較的良好な性能が得られることを示す。
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