論文の概要: GeoScatt-GNN: A Geometric Scattering Transform-Based Graph Neural Network Model for Ames Mutagenicity Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.15331v1
- Date: Fri, 22 Nov 2024 19:52:56 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-26 14:22:29.671979
- Title: GeoScatt-GNN: A Geometric Scattering Transform-Based Graph Neural Network Model for Ames Mutagenicity Prediction
- Title(参考訳): GeoScatt-GNN: Ames Mutagenicity Predictionのための幾何学散乱変換型グラフニューラルネットワークモデル
- Authors: Abdeljalil Zoubir, Badr Missaoui,
- Abstract要約: 本稿では, 3つの接地的アプローチを導入することで, 変異原性予測の急激な課題に取り組む。
まず,従来の分子ディスクリプタと比較して,分子画像から抽出した2次元散乱係数の優れた性能を示す。
第2に、幾何学グラフ散乱(GGS)、グラフ同型ネットワーク(GIN)、機械学習モデルを組み合わせて、変異原性予測において強力な結果を得るハイブリッドアプローチを提案する。
第3に、新しいグラフニューラルネットワークアーキテクチャMOLG3-SAGEを導入し、GGSノード機能を完全に連結されたグラフ構造に統合し、優れた予測精度を実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
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- Abstract: This paper tackles the pressing challenge of mutagenicity prediction by introducing three ground-breaking approaches. First, it showcases the superior performance of 2D scattering coefficients extracted from molecular images, compared to traditional molecular descriptors. Second, it presents a hybrid approach that combines geometric graph scattering (GGS), Graph Isomorphism Networks (GIN), and machine learning models, achieving strong results in mutagenicity prediction. Third, it introduces a novel graph neural network architecture, MOLG3-SAGE, which integrates GGS node features into a fully connected graph structure, delivering outstanding predictive accuracy. Experimental results on the ZINC dataset demonstrate significant improvements, emphasizing the effectiveness of blending 2D and geometric scattering techniques with graph neural networks. This study illustrates the potential of GNNs and GGS for mutagenicity prediction, with broad implications for drug discovery and chemical safety assessment.
- Abstract(参考訳): 本稿では, 3つの接地的アプローチを導入することで, 変異原性予測の急激な課題に取り組む。
まず,従来の分子ディスクリプタと比較して,分子画像から抽出した2次元散乱係数の優れた性能を示す。
第2に、幾何学グラフ散乱(GGS)、グラフ同型ネットワーク(GIN)、機械学習モデルを組み合わせて、変異原性予測において強力な結果を得るハイブリッドアプローチを提案する。
第3に、新しいグラフニューラルネットワークアーキテクチャMOLG3-SAGEを導入し、GGSノード機能を完全に連結されたグラフ構造に統合し、優れた予測精度を実現する。
ZINCデータセットの実験結果は、グラフニューラルネットワークと2Dおよび幾何散乱技術を組み合わせることの有効性を強調し、大幅な改善を示した。
本研究は, 変異原性予測におけるGNNとGGSの可能性を示す。
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