論文の概要: Generative Model for Synthesizing Ionizable Lipids: A Monte Carlo Tree Search Approach
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.00807v1
- Date: Sun, 01 Dec 2024 13:34:22 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-04 15:47:47.889842
- Title: Generative Model for Synthesizing Ionizable Lipids: A Monte Carlo Tree Search Approach
- Title(参考訳): イオン化可能な脂質の合成モデル:モンテカルロ木探索手法
- Authors: Jingyi Zhao, Yuxuan Ou, Austin Tripp, Morteza Rasoulianboroujeni, José Miguel Hernández-Lobato,
- Abstract要約: イオン化可能な脂質は、効果的なメッセンジャーRNA(mRNA)輸送のための脂質ナノ粒子(LNP)の開発に必須である。
新しい電離可能な脂質を設計する伝統的な手法は一般的に時間を要するものであり、強力な解決策として深層生成モデルが登場している。
本研究は, 合成可能な電離性脂質に対するモンテカルロ木探索(MCTS)に基づく生成モデルについて検討する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 28.132346875941707
- License:
- Abstract: Ionizable lipids are essential in developing lipid nanoparticles (LNPs) for effective messenger RNA (mRNA) delivery. While traditional methods for designing new ionizable lipids are typically time-consuming, deep generative models have emerged as a powerful solution, significantly accelerating the molecular discovery process. However, a practical challenge arises as the molecular structures generated can often be difficult or infeasible to synthesize. This project explores Monte Carlo tree search (MCTS)-based generative models for synthesizable ionizable lipids. Leveraging a synthetically accessible lipid building block dataset and two specialized predictors to guide the search through chemical space, we introduce a policy network guided MCTS generative model capable of producing new ionizable lipids with available synthesis pathways.
- Abstract(参考訳): イオン化可能な脂質は、効果的なメッセンジャーRNA(mRNA)輸送のための脂質ナノ粒子(LNP)の開発に必須である。
新しいイオン化可能な脂質を設計する従来の方法は一般的に時間を要するが、深い生成モデルは強力な解法として登場し、分子発見過程を著しく加速している。
しかし、生成した分子構造は、しばしば合成が困難または不可能になるため、現実的な課題が生じる。
本研究は, 合成可能な電離性脂質に対するモンテカルロ木探索(MCTS)に基づく生成モデルについて検討する。
合成可能な脂質構築ブロックデータセットと2つの特殊な予測器を用いて化学空間を探索し,新しいイオン化可能な脂質を合成経路で生成するMCTS生成モデルを提案する。
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