論文の概要: Adult Glioma Segmentation in Sub-Saharan Africa using Transfer Learning on Stratified Finetuning Data

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.04111v2
• Date: Fri, 20 Dec 2024 23:06:13 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2024-12-24 15:51:19.866639
• Title: Adult Glioma Segmentation in Sub-Saharan Africa using Transfer Learning on Stratified Finetuning Data
• Title（参考訳）: サハラ以南のアフリカにおける成体のグリオーマ分節
• Authors: Abhijeet Parida, Daniel Capellán-Martín, Zhifan Jiang, Austin Tapp, Xinyang Liu, Syed Muhammad Anwar, María J. Ledesma-Carbayo, Marius George Linguraru,
• Abstract要約: グリオーマは低所得国、中所得国、特にサハラ以南のアフリカで診断上の課題を呈している。 本稿では、最小限のMRIデータと低品質のMRIデータを用いて、リソース制限領域の課題に対処するために、トランスファーラーニングを用いたグリオーマセグメンテーションの新しいアプローチを提案する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 6.14919256198409
• License:
• Abstract: Gliomas, a kind of brain tumor characterized by high mortality, present substantial diagnostic challenges in low- and middle-income countries, particularly in Sub-Saharan Africa. This paper introduces a novel approach to glioma segmentation using transfer learning to address challenges in resource-limited regions with minimal and low-quality MRI data. We leverage pre-trained deep learning models, nnU-Net and MedNeXt, and apply a stratified fine-tuning strategy using the BraTS2023-Adult-Glioma and BraTS-Africa datasets. Our method exploits radiomic analysis to create stratified training folds, model training on a large brain tumor dataset, and transfer learning to the Sub-Saharan context. A weighted model ensembling strategy and adaptive post-processing are employed to enhance segmentation accuracy. The evaluation of our proposed method on unseen validation cases on the BraTS-Africa 2024 task resulted in lesion-wise mean Dice scores of 0.870, 0.865, and 0.926, for enhancing tumor, tumor core, and whole tumor regions and was ranked first for the challenge. Our approach highlights the ability of integrated machine-learning techniques to bridge the gap between the medical imaging capabilities of resource-limited countries and established developed regions. By tailoring our methods to a target population's specific needs and constraints, we aim to enhance diagnostic capabilities in isolated environments. Our findings underscore the importance of approaches like local data integration and stratification refinement to address healthcare disparities, ensure practical applicability, and enhance impact. A dockerized version of the BraTS-Africa 2024 winning algorithm is available at https://hub.docker.com/r/aparida12/brats-ssa-2024 .
• Abstract（参考訳）: 高死亡率を特徴とする脳腫瘍の一種であるグリオーマは、低所得国や中所得国、特にサハラ以南のアフリカで深刻な診断上の課題を呈している。 本稿では、最小限のMRIデータと低品質のMRIデータを用いて、リソース制限領域の課題に対処するために、トランスファーラーニングを用いたグリオーマセグメンテーションの新しいアプローチを提案する。 トレーニング済みのディープラーニングモデルであるnnU-NetとMedNeXtを活用し、BraTS2023-Adult-GliomaとBraTS-Africaデータセットを用いて、階層化された微調整戦略を適用する。 本手法は放射能解析を利用して層状化トレーニングフォールドを作成し,脳腫瘍データセットのモデルトレーニングを行い,サブサハラの文脈に学習を伝達する。 セグメンテーション精度を高めるため、重み付きモデルアンサンブル戦略と適応後処理を用いる。 提案手法によるBraTS-Africa 2024タスクの未確認評価の結果,腫瘍,腫瘍コア,腫瘍全領域のDiceスコアが0.870,0.865,0.926となり,第1位となった。 本手法は,資源制限国と確立した先進地域の医療画像能力のギャップを埋めるために,統合型機械学習技術が有効であることを示す。 対象者の特定のニーズや制約に合わせて手法を調整することで,孤立した環境における診断能力を向上することを目指す。 我々の発見は、医療格差に対処し、実用的な適用性を確保し、影響を高めるために、ローカルなデータ統合や階層化の洗練といったアプローチの重要性を強調します。 BraTS-Africa 2024のドッカー化バージョンはhttps://hub.docker.com/r/aparida12/brats-ssa-2024で入手できる。

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