論文の概要: SegHeD+: Segmentation of Heterogeneous Data for Multiple Sclerosis Lesions with Anatomical Constraints and Lesion-aware Augmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.10946v1
- Date: Sat, 14 Dec 2024 19:44:25 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-17 13:59:58.700646
- Title: SegHeD+: Segmentation of Heterogeneous Data for Multiple Sclerosis Lesions with Anatomical Constraints and Lesion-aware Augmentation
- Title(参考訳): SegHeD+: 解剖学的制約と病変認識増強を伴う多発性硬化症病変に対する異種データの分割
- Authors: Berke Doga Basaran, Paul M. Matthews, Wenjia Bai,
- Abstract要約: 複数のデータセットやタスクを扱える新しいセグメンテーションモデルであるSegHeD+を紹介します。
分割モデルに経時的,解剖学的,体積的制約を組み込むことにより,MS病変に関するドメイン知識を統合する。
SegHeD+は5つのMSデータセットで評価され、すべての、新しい、消滅する病変のセグメンテーションにおいて優れたパフォーマンスを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.6365496769445946
- License:
- Abstract: Assessing lesions and tracking their progression over time in brain magnetic resonance (MR) images is essential for diagnosing and monitoring multiple sclerosis (MS). Machine learning models have shown promise in automating the segmentation of MS lesions. However, training these models typically requires large, well-annotated datasets. Unfortunately, MS imaging datasets are often limited in size, spread across multiple hospital sites, and exhibit different formats (such as cross-sectional or longitudinal) and annotation styles. This data diversity presents a significant obstacle to developing a unified model for MS lesion segmentation. To address this issue, we introduce SegHeD+, a novel segmentation model that can handle multiple datasets and tasks, accommodating heterogeneous input data and performing segmentation for all lesions, new lesions, and vanishing lesions. We integrate domain knowledge about MS lesions by incorporating longitudinal, anatomical, and volumetric constraints into the segmentation model. Additionally, we perform lesion-level data augmentation to enlarge the training set and further improve segmentation performance. SegHeD+ is evaluated on five MS datasets and demonstrates superior performance in segmenting all, new, and vanishing lesions, surpassing several state-of-the-art methods in the field.
- Abstract(参考訳): 脳磁気共鳴(MR)画像における病変の評価と経過の追跡は多発性硬化症(MS)の診断とモニタリングに不可欠である。
機械学習モデルは、MS病変のセグメンテーションを自動化することを約束している。
しかし、これらのモデルのトレーニングは通常、大きく、よく注釈付けされたデータセットを必要とする。
残念なことに、MSイメージングデータセットはサイズが制限され、複数の病院に分散し、異なるフォーマット(断面や縦方向など)とアノテーションスタイルを示すことが多い。
このデータ多様性は、MS病変のセグメンテーションのための統一モデルを開発する上で重要な障害となる。
この問題に対処するために、SegHeD+は、複数のデータセットとタスクを扱える新しいセグメンテーションモデルを導入し、不均一な入力データを調整し、すべての病変、新しい病変、消失する病変のセグメンテーションを実行する。
分割モデルに経時的,解剖学的,体積的制約を組み込むことにより,MS病変に関するドメイン知識を統合する。
さらに、トレーニングセットを拡大し、セグメンテーション性能をさらに向上するために、病変レベルのデータ拡張を行う。
SegHeD+は5つのMSデータセットで評価され、すべての、新しい、消滅する病変のセグメンテーションにおいて優れたパフォーマンスを示し、この分野における最先端の手法を超越している。
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