論文の概要: SegHeD: Segmentation of Heterogeneous Data for Multiple Sclerosis Lesions with Anatomical Constraints
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.01766v1
- Date: Wed, 2 Oct 2024 17:21:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-11-04 15:24:19.087577
- Title: SegHeD: Segmentation of Heterogeneous Data for Multiple Sclerosis Lesions with Anatomical Constraints
- Title(参考訳): 解剖学的制約を伴う多発性硬化症病変に対するSegHeDの有用性
- Authors: Berke Doga Basaran, Xinru Zhang, Paul M. Matthews, Wenjia Bai,
- Abstract要約: 機械学習モデルは、自動MS病変セグメンテーションの大きな可能性を実証している。
SegHeDは、異種データを入力として組み込むことができる、新しいマルチデータセットマルチタスクセグメンテーションモデルである。
SegHeDは5つのMSデータセットで評価され、すべての、新しい、消滅するセグメンテーションで高いパフォーマンスを達成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.498084483844508
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Assessment of lesions and their longitudinal progression from brain magnetic resonance (MR) images plays a crucial role in diagnosing and monitoring multiple sclerosis (MS). Machine learning models have demonstrated a great potential for automated MS lesion segmentation. Training such models typically requires large-scale high-quality datasets that are consistently annotated. However, MS imaging datasets are often small, segregated across multiple sites, with different formats (cross-sectional or longitudinal), and diverse annotation styles. This poses a significant challenge to train a unified MS lesion segmentation model. To tackle this challenge, we present SegHeD, a novel multi-dataset multi-task segmentation model that can incorporate heterogeneous data as input and perform all-lesion, new-lesion, as well as vanishing-lesion segmentation. Furthermore, we account for domain knowledge about MS lesions, incorporating longitudinal, spatial, and volumetric constraints into the segmentation model. SegHeD is assessed on five MS datasets and achieves a high performance in all, new, and vanishing-lesion segmentation, outperforming several state-of-the-art methods in this field.
- Abstract(参考訳): 多発性硬化症 (MS) の診断・モニタリングにおいて, 脳MRI画像からの病変の評価とその経時的進展が重要な役割を担っている。
機械学習モデルは、自動MS病変セグメンテーションの大きな可能性を実証している。
このようなモデルのトレーニングは通常、一貫して注釈付けされた大規模で高品質なデータセットを必要とする。
しかし、MSイメージングデータセットは、しばしば小さく、複数の部位にまたがって分離され、異なるフォーマット(断面または縦方向)と多様なアノテーションスタイルを持つ。
これは統合MS病変セグメンテーションモデルをトレーニングする上で大きな課題となる。
この課題に対処するために,異種データを入力として組み込んだ新しいマルチデータセットマルチタスクセグメンテーションモデルであるSegHeDを提案する。
さらに,MS病変の領域知識を考慮し,時間的,空間的,体積的制約をセグメンテーションモデルに組み込んだ。
SegHeDは5つのMSデータセットに基づいて評価され、すべての、新しい、そして消滅するセグメンテーションにおいて高いパフォーマンスを達成する。
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