論文の概要: Head and Neck Tumor Segmentation of MRI from Pre- and Mid-radiotherapy with Pre-training, Data Augmentation and Dual Flow UNet
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.14846v1
- Date: Thu, 19 Dec 2024 13:38:20 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-20 13:32:38.546532
- Title: Head and Neck Tumor Segmentation of MRI from Pre- and Mid-radiotherapy with Pre-training, Data Augmentation and Dual Flow UNet
- Title(参考訳): プレトレーニング, データ拡張, デュアルフローUNetによる放射線治療前後のMRI頭頸部腫瘍分節の検討
- Authors: Litingyu Wang, Wenjun Liao, Shichuan Zhang, Guotai Wang,
- Abstract要約: 放射線前療法 (pre-RT) と中放射線中療法 (mid-RT) のセグメンテーションに対する複数戦略の効果を検討した。
そこで我々は,中RT画像の分離エンコーダとラベル付きPre-RT画像の登録を行う,新しい計算フレンドリなネットワークアーキテクチャを導入した。
我々のモデルは,HiLabとして集計したDice similarity Coefficient (DSC)上で,プレRTでは82.38%,ミッドRTでは72.53%のセグメンテーション性能を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.686509350480552
- License:
- Abstract: Head and neck tumors and metastatic lymph nodes are crucial for treatment planning and prognostic analysis. Accurate segmentation and quantitative analysis of these structures require pixel-level annotation, making automated segmentation techniques essential for the diagnosis and treatment of head and neck cancer. In this study, we investigated the effects of multiple strategies on the segmentation of pre-radiotherapy (pre-RT) and mid-radiotherapy (mid-RT) images. For the segmentation of pre-RT images, we utilized: 1) a fully supervised learning approach, and 2) the same approach enhanced with pre-trained weights and the MixUp data augmentation technique. For mid-RT images, we introduced a novel computational-friendly network architecture that features separate encoders for mid-RT images and registered pre-RT images with their labels. The mid-RT encoder branch integrates information from pre-RT images and labels progressively during the forward propagation. We selected the highest-performing model from each fold and used their predictions to create an ensemble average for inference. In the final test, our models achieved a segmentation performance of 82.38% for pre-RT and 72.53% for mid-RT on aggregated Dice Similarity Coefficient (DSC) as HiLab. Our code is available at https://github.com/WltyBY/HNTS-MRG2024_train_code.
- Abstract(参考訳): 頭頸部腫瘍と転移リンパ節は治療計画と予後解析に重要である。
これらの構造の正確なセグメンテーションと定量的分析にはピクセルレベルのアノテーションが必要であり、頭頸部がんの診断と治療には自動セグメンテーション技術が不可欠である。
本研究では,放射線前療法(pre-RT)と中放射線中療法(mid-RT)のセグメンテーションに対する複数の戦略の効果を検討した。
プレRT画像のセグメンテーションには、次のように利用した。
1)完全教師付き学習アプローチ,及び
2) 既訓練重量とMixUpデータ拡張技術により, 同様のアプローチが強化された。
そこで我々は,中RT画像の分離エンコーダとラベル付きPre-RT画像の登録を行う,新しい計算フレンドリなネットワークアーキテクチャを導入した。
中間RTエンコーダブランチは、前方伝播中に、事前RT画像やラベルからの情報を徐々に統合する。
我々は,各折り畳みから最高の性能モデルを選択し,その予測を用いて推定のアンサンブル平均を作成した。
最終試験では, プレRTでは82.38%, 中間RTでは72.53%のセグメンテーション性能を, 集計したDice similarity Coefficient (DSC) をHiLabとして達成した。
私たちのコードはhttps://github.com/WltyBY/HNTS-MRG2024_train_codeで利用可能です。
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