論文の概要: Efficient Algorithm for Sparse Fourier Transform of Generalized $q$-ary Functions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.12365v2
- Date: Mon, 21 Apr 2025 00:23:46 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-22 15:07:02.154686
- Title: Efficient Algorithm for Sparse Fourier Transform of Generalized $q$-ary Functions
- Title(参考訳): 一般化$q$-ary関数のスパースフーリエ変換の効率的なアルゴリズム
- Authors: Darin Tsui, Kunal Talreja, Amirali Aghazadeh,
- Abstract要約: GFastはFourier変換を$f$、サンプル複雑性は$O(Sn)$で計算する符号化理論アルゴリズムである。
GFastは、実世界の心臓疾患の診断とタンパク質の適合性モデルの説明を、最大13時間分のサンプルで行える。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.3004066195320147
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Computing the Fourier transform of a $q$-ary function $f:\mathbb{Z}_{q}^n\rightarrow \mathbb{R}$, which maps $q$-ary sequences to real numbers, is an important problem in mathematics with wide-ranging applications in biology, signal processing, and machine learning. Previous studies have shown that, under the sparsity assumption, the Fourier transform can be computed efficiently using fast and sample-efficient algorithms. However, in most practical settings, the function is defined over a more general space -- the space of generalized $q$-ary sequences $\mathbb{Z}_{q_1} \times \mathbb{Z}_{q_2} \times \cdots \times \mathbb{Z}_{q_n}$ -- where each $\mathbb{Z}_{q_i}$ corresponds to integers modulo $q_i$. Herein, we develop GFast, a coding theoretic algorithm that computes the $S$-sparse Fourier transform of $f$ with a sample complexity of $O(Sn)$, computational complexity of $O(Sn \log N)$, and a failure probability that approaches zero as $N=\prod_{i=1}^n q_i \rightarrow \infty$ with $S = N^\delta$ for some $0 \leq \delta < 1$. We show that a noise-robust version of GFast computes the transform with a sample complexity of $O(Sn^2)$ and computational complexity of $O(Sn^2 \log N)$ under the same high probability guarantees. Additionally, we demonstrate that GFast computes the sparse Fourier transform of generalized $q$-ary functions $8\times$ faster using $16\times$ fewer samples on synthetic experiments, and enables explaining real-world heart disease diagnosis and protein fitness models using up to $13\times$ fewer samples compared to existing Fourier algorithms applied to the most efficient parameterization of the models as $q$-ary functions.
- Abstract(参考訳): q$-ary 関数 $f:\mathbb{Z}_{q}^n\rightarrow \mathbb{R}$ のフーリエ変換を計算し、$q$-ary 列を実数に写し、生物学、信号処理、機械学習の幅広い応用を持つ数学において重要な問題である。
従来の研究では、疎性仮定の下で、フーリエ変換は高速でサンプル効率のよいアルゴリズムを用いて効率的に計算できることが示されている。
一般化された$q$-ary Sequences $\mathbb{Z}_{q_1} \times \mathbb{Z}_{q_2} \times \cdots \mathbb{Z}_{q_n}$ -- ここで、各$\mathbb{Z}_{q_i}$は整数 modulo $q_i$ に対応する。
ここで、GFastは、$S$スパースフーリエ変換を$O(Sn)$で計算し、$O(Sn \log N)$で計算複雑性を計算し、$N=\prod_{i=1}^n q_i \rightarrow \infty$で0に近づく失敗確率を$S = N^\delta$ for some $0 \leq \delta < 1$で計算する。
GFastのノイズロスバージョンは、同じ高い確率保証の下で、サンプル複雑性$O(Sn^2)$と計算複雑性$O(Sn^2 \log N)$で変換を計算する。
さらに、GFastは、一般化された$q$-ary関数のスパースフーリエ変換を、合成実験において16ドル以上で高速に計算し、13ドル以上で現実世界の心臓疾患診断およびタンパク質適合モデルの説明を可能にする。
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