論文の概要: Academic case reports lack diversity: Assessing the presence and diversity of sociodemographic and behavioral factors related to Post COVID-19 Condition

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.12538v3
• Date: Mon, 24 Feb 2025 02:29:35 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-02-25 15:50:16.951072
• Title: Academic case reports lack diversity: Assessing the presence and diversity of sociodemographic and behavioral factors related to Post COVID-19 Condition
• Title（参考訳）: アカデミック・ケース・レポートでは多様性が欠如している: COVID-19後の症状に関連する社会デマトグラフィーおよび行動要因の存在と多様性の評価
• Authors: Juan Andres Medina Florez, Shaina Raza, Rashida Lynn, Zahra Shakeri, Brendan T. Smith, Elham Dolatabadi,
• Abstract要約: 本研究は,健康の社会的決定因子をPCC研究に統合するための包括的枠組みを開発することを目的とする。 NER、自然言語推論(NLI)、トリグラム、周波数分析を統合したNLPパイプラインを開発し、これらのエンティティを抽出し分析した。 探索的な分析により、状態、年齢、ケアへのアクセスといった一般的なエンティティと、人種や住居の状態といったセンシティブなカテゴリーの不足が明らかになった。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 2.062409092695415
• License:
• Abstract: Understanding the prevalence, disparities, and symptom variations of Post COVID-19 Condition (PCC) for vulnerable populations is crucial to improving care and addressing intersecting inequities. This study aims to develop a comprehensive framework for integrating social determinants of health (SDOH) into PCC research by leveraging NLP techniques to analyze disparities and variations in SDOH representation within PCC case reports. Following construction of a PCC Case Report Corpus, comprising over 7,000 case reports from the LitCOVID repository, a subset of 709 reports were annotated with 26 core SDOH-related entity types using pre-trained named entity recognition (NER) models, human review, and data augmentation to improve quality, diversity and representation of entity types. An NLP pipeline integrating NER, natural language inference (NLI), trigram and frequency analyses was developed to extract and analyze these entities. Both encoder-only transformer models and RNN-based models were assessed for the NER objective. Fine-tuned encoder-only BERT models outperformed traditional RNN-based models in generalizability to distinct sentence structures and greater class sparsity. Exploratory analysis revealed variability in entity richness, with prevalent entities like condition, age, and access to care, and underrepresentation of sensitive categories like race and housing status. Trigram analysis highlighted frequent co-occurrences among entities, including age, gender, and condition. The NLI objective (entailment and contradiction analysis) showed attributes like "Experienced violence or abuse" and "Has medical insurance" had high entailment rates (82.4%-80.3%), while attributes such as "Is female-identifying," "Is married," and "Has a terminal condition" exhibited high contradiction rates (70.8%-98.5%).
• Abstract（参考訳）: 脆弱な人口に対するポストCOVID-19条件(PCC)の頻度、格差、症状の変化を理解することは、ケアの改善と交差する不平等への対処に不可欠である。 本研究の目的は、NLP技術を活用して、PCC事例報告におけるSDOH表現の相違と相違を解析し、SDOHをPCC研究に統合するための総合的な枠組みを開発することである。 LitCOVIDレポジトリから7000件を超えるケースレポートからなるPCC Case Report Corpusの構築に続いて、709件のレポートのサブセットに、事前訓練された名前付きエンティティ認識(NER)モデル、ヒューマンレビュー、データ拡張を使用して、26コアのSDOH関連エンティティタイプを注釈付けし、エンティティタイプの品質、多様性、表現を改善した。 NER、自然言語推論(NLI)、トリグラム、周波数分析を統合したNLPパイプラインを開発し、これらのエンティティを抽出し分析した。 エンコーダのみのトランスモデルとRNNベースのモデルの両方がNERの目的のために評価された。 微調整エンコーダのみのBERTモデルは、異なる文構造とより大きなクラス間隔に一般化可能な従来のRNNベースのモデルよりも優れていた。 探索的な分析により、状態、年齢、ケアへのアクセスといった一般的なエンティティと、人種や住居の状態といったセンシティブなカテゴリーの不足が明らかになった。 トリグラム分析では, 年齢, 性別, 状態など, 集団間の共起が頻発していた。 NLIの目標は「経験的暴力や虐待」や「ハス医療保険」のような属性が82.4%-80.3%であり、「女性識別」、「結婚」、「ハス・ア・ターミナル条件」といった属性が70.8%-98.5%であった。

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