論文の概要: UniZyme: A Unified Protein Cleavage Site Predictor Enhanced with Enzyme Active-Site Knowledge

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2502.06914v1
• Date: Mon, 10 Feb 2025 09:46:26 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-02-12 14:08:38.515695
• Title: UniZyme: A Unified Protein Cleavage Site Predictor Enhanced with Enzyme Active-Site Knowledge
• Title（参考訳）: UniZyme:酵素の能動的知識で強化された統一タンパク質切断サイト予測器
• Authors: Chenao Li, Shuo Yan, Enyan Dai,
• Abstract要約: タンパク質切断部位予測法として, タンパク質切断部位予測法を導入し, 多様な酵素をまたいで一般化する。 方法は、未確認酵素を含む様々なタンパク質分解酵素の切断部位の予測において高い精度を達成する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 10.678089839728889
• License:
• Abstract: Enzyme-catalyzed protein cleavage is essential for many biological functions. Accurate prediction of cleavage sites can facilitate various applications such as drug development, enzyme design, and a deeper understanding of biological mechanisms. However, most existing models are restricted to an individual enzyme, which neglects shared knowledge of enzymes and fails generalize to novel enzymes. Thus, we introduce a unified protein cleavage site predictor named {\method}, which can generalize across diverse enzymes. To enhance the enzyme encoding for the protein cleavage site prediction, {\method} employs a novel biochemically-informed model architecture along with active-site knowledge of proteolytic enzymes. Extensive experiments demonstrate that {\method} achieves high accuracy in predicting cleavage sites across a range of proteolytic enzymes, including unseen enzymes. The code is available in https://anonymous.4open.science/r/UniZyme-4A67.
• Abstract（参考訳）: 酵素触媒によるタンパク質切断は多くの生物学的機能に必須である。 切断部位の正確な予測は、薬物開発、酵素設計、生物学的メカニズムのより深い理解など、様々な応用を促進することができる。 しかし、既存のモデルのほとんどは、酵素の共有知識を無視し、新しい酵素に一般化できない個々の酵素に限られている。 そこで我々は,多様な酵素をまたいで一般化可能なタンパク質切断部位予測器 {\method} を導入する。 タンパク質切断部位の予測のための酵素のエンコーディングを強化するために、 {\method} は、新規な生化学的インフォームドモデルアーキテクチャと、タンパク質分解酵素の活性部位知識を用いている。 広範囲にわたる実験により、不明瞭な酵素を含む様々なタンパク質分解酵素の切断部位の予測において高い精度を達成することが示されている。 コードはhttps://anonymous.4open.science/r/UniZyme-4A67で公開されている。

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