論文の概要: DynaGraph: Interpretable Multi-Label Prediction from EHRs via Dynamic Graph Learning and Contrastive Augmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.22257v1
- Date: Fri, 28 Mar 2025 09:13:30 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-31 15:28:39.349529
- Title: DynaGraph: Interpretable Multi-Label Prediction from EHRs via Dynamic Graph Learning and Contrastive Augmentation
- Title(参考訳): DynaGraph: 動的グラフ学習とコントラスト拡張によるEHRからの解釈可能なマルチラベル予測
- Authors: Munib Mesinovic, Soheila Molaei, Peter Watkinson, Tingting Zhu,
- Abstract要約: DynaGraphは、エンドツーエンドの解釈可能なコントラストグラフモデルである。
実世界の4つの臨床データセットでモデルを検証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.196633071421455
- License:
- Abstract: Learning from longitudinal electronic health records is limited if it does not capture the temporal trajectories of the patient's state in a clinical setting. Graph models allow us to capture the hidden dependencies of the multivariate time-series when the graphs are constructed in a similar dynamic manner. Previous dynamic graph models require a pre-defined and/or static graph structure, which is unknown in most cases, or they only capture the spatial relations between the features. Furthermore in healthcare, the interpretability of the model is an essential requirement to build trust with clinicians. In addition to previously proposed attention mechanisms, there has not been an interpretable dynamic graph framework for data from multivariate electronic health records (EHRs). Here, we propose DynaGraph, an end-to-end interpretable contrastive graph model that learns the dynamics of multivariate time-series EHRs as part of optimisation. We validate our model in four real-world clinical datasets, ranging from primary care to secondary care settings with broad demographics, in challenging settings where tasks are imbalanced and multi-labelled. Compared to state-of-the-art models, DynaGraph achieves significant improvements in balanced accuracy and sensitivity over the nearest complex competitors in time-series or dynamic graph modelling across three ICU and one primary care datasets. Through a pseudo-attention approach to graph construction, our model also indicates the importance of clinical covariates over time, providing means for clinical validation.
- Abstract(参考訳): 患者状態の経時的軌跡を臨床的に把握しなければ, 経時的電子的健康記録からの学習は限られる。
グラフモデルにより、グラフが同様の動的に構築されたとき、多変量時系列の隠れた依存関係をキャプチャできる。
従来の動的グラフモデルには事前定義された静的グラフ構造が必要であり、ほとんどの場合不明である。
さらに、医療において、モデルの解釈可能性は、臨床医との信頼を構築するために必須の要件である。
これまでに提案された注意機構に加えて,多変量電子健康記録(EHR)のデータに対する解釈可能な動的グラフフレームワークも存在していない。
本稿では,多変量時系列EHRのダイナミクスを最適化の一部として学習する,エンドツーエンドで解釈可能なコントラストグラフモデルDynaGraphを提案する。
われわれのモデルを,プライマリケアからセカンダリケアまでの4つの実世界臨床データセットで検証し,タスクの不均衡やマルチラベリングといった課題に対処する。
最先端モデルと比較して、DynaGraphは3つのICUと1つのプライマリケアデータセットをまたいだ動的グラフモデリングにおいて、最も近い複雑な競合相手に比べて、バランスの取れた精度と感度の大幅な改善を実現している。
また,グラフ構築に対する疑似注意的アプローチにより,臨床検体の重要性が示唆され,臨床検体としての有用性が示唆された。
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