論文の概要: HarmonySeg: Tubular Structure Segmentation with Deep-Shallow Feature Fusion and Growth-Suppression Balanced Loss
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.07827v1
- Date: Thu, 10 Apr 2025 15:04:42 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-11 12:24:41.693566
- Title: HarmonySeg: Tubular Structure Segmentation with Deep-Shallow Feature Fusion and Growth-Suppression Balanced Loss
- Title(参考訳): HarmonySeg:Deep-Shallow Feature FusionとGrowth-Suppression Balanced Lossを併用した管状構造分割
- Authors: Yi Huang, Ke Zhang, Wei Liu, Yuanyuan Wang, Vishal M. Patel, Le Lu, Xu Han, Dakai Jin, Ke Yan,
- Abstract要約: 我々はHarmonySegという新しい管状構造セグメンテーションフレームワークを提案する。
まず、様々な受容場を持つ柔軟な畳み込みブロックを備えたディープ・ツー・シャロー・デコーダネットワークを設計する。
第2に, 解剖学的領域を強調し, 小さな管状構造のリコールを改善するために, 血管性マップを組み込んだ。
第3に, 管状構造物の成長と抑制のバランスをとるために, 文脈と形状の先行性を活用するトポロジー保存損失関数を導入する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 37.79956077478527
- License:
- Abstract: Accurate segmentation of tubular structures in medical images, such as vessels and airway trees, is crucial for computer-aided diagnosis, radiotherapy, and surgical planning. However, significant challenges exist in algorithm design when faced with diverse sizes, complex topologies, and (often) incomplete data annotation of these structures. We address these difficulties by proposing a new tubular structure segmentation framework named HarmonySeg. First, we design a deep-to-shallow decoder network featuring flexible convolution blocks with varying receptive fields, which enables the model to effectively adapt to tubular structures of different scales. Second, to highlight potential anatomical regions and improve the recall of small tubular structures, we incorporate vesselness maps as auxiliary information. These maps are aligned with image features through a shallow-and-deep fusion module, which simultaneously eliminates unreasonable candidates to maintain high precision. Finally, we introduce a topology-preserving loss function that leverages contextual and shape priors to balance the growth and suppression of tubular structures, which also allows the model to handle low-quality and incomplete annotations. Extensive quantitative experiments are conducted on four public datasets. The results show that our model can accurately segment 2D and 3D tubular structures and outperform existing state-of-the-art methods. External validation on a private dataset also demonstrates good generalizability.
- Abstract(参考訳): 血管や気道木などの医用画像における管状構造の正確なセグメンテーションは,コンピュータ支援診断,放射線治療,手術計画に不可欠である。
しかし、様々な大きさ、複雑なトポロジ、そして(しばしば)これらの構造の不完全なデータアノテーションに直面する場合、アルゴリズム設計において重大な課題が存在する。
本稿では,ハーモニーセグ(HarmonySeg)という新しい管状構造セグメンテーションフレームワークを提案することで,これらの課題に対処する。
まず,様々な受容場を持つ柔軟な畳み込みブロックを備えたディープ・ツー・シャロー・デコーダネットワークを設計し,モデルが異なるスケールの管状構造に効果的に適応できるようにする。
第2に,潜在的解剖学的領域を強調し,小管構造のリコールを改善するために,補助情報として血管地図を組み込んだ。
これらのマップは、浅い深度融合モジュールを通して画像の特徴と整列し、高い精度を維持するために不合理な候補を同時に排除する。
最後に,構造体の成長と抑制のバランスをとるために,文脈や形状の先行を活かした位相保存損失関数を導入し,低品質かつ不完全なアノテーションを扱えるようにした。
大規模な定量的実験は4つの公開データセットで実施される。
その結果,本モデルでは2次元および3次元管状構造を正確にセグメント化し,既存の最先端手法より優れた性能が得られることがわかった。
プライベートデータセットの外部検証も、優れた一般化性を示している。
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