論文の概要: Early Detection of Multidrug Resistance Using Multivariate Time Series Analysis and Interpretable Patient-Similarity Representations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.17717v1
- Date: Thu, 24 Apr 2025 16:19:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-02 19:15:53.463888
- Title: Early Detection of Multidrug Resistance Using Multivariate Time Series Analysis and Interpretable Patient-Similarity Representations
- Title(参考訳): 多変量時系列解析と解釈可能な患者類似表現を用いた多剤耐性の早期検出
- Authors: Óscar Escudero-Arnanz, Antonio G. Marques, Inmaculada Mora-Jiménez, Joaquín Álvarez-Rodríguez, Cristina Soguero-Ruiz,
- Abstract要約: マルチドラッグ抵抗(MDR)は、世界的な健康問題であり、入院、医療費、死亡率の上昇を引き起こす。
本研究では,MDR予測のための解釈可能な機械学習フレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.062368743143388
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Background and Objectives: Multidrug Resistance (MDR) is a critical global health issue, causing increased hospital stays, healthcare costs, and mortality. This study proposes an interpretable Machine Learning (ML) framework for MDR prediction, aiming for both accurate inference and enhanced explainability. Methods: Patients are modeled as Multivariate Time Series (MTS), capturing clinical progression and patient-to-patient interactions. Similarity among patients is quantified using MTS-based methods: descriptive statistics, Dynamic Time Warping, and Time Cluster Kernel. These similarity measures serve as inputs for MDR classification via Logistic Regression, Random Forest, and Support Vector Machines, with dimensionality reduction and kernel transformations improving model performance. For explainability, patient similarity networks are constructed from these metrics. Spectral clustering and t-SNE are applied to identify MDR-related subgroups and visualize high-risk clusters, enabling insight into clinically relevant patterns. Results: The framework was validated on ICU Electronic Health Records from the University Hospital of Fuenlabrada, achieving an AUC of 81%. It outperforms baseline ML and deep learning models by leveraging graph-based patient similarity. The approach identifies key risk factors -- prolonged antibiotic use, invasive procedures, co-infections, and extended ICU stays -- and reveals clinically meaningful clusters. Code and results are available at \https://github.com/oscarescuderoarnanz/DM4MTS. Conclusions: Patient similarity representations combined with graph-based analysis provide accurate MDR prediction and interpretable insights. This method supports early detection, risk factor identification, and patient stratification, highlighting the potential of explainable ML in critical care.
- Abstract(参考訳): 背景と目的:MDR(Multidrug resistance)は、世界的な健康問題であり、入院、医療費、死亡率の上昇を引き起こしている。
本研究では,MDR予測のための解釈可能な機械学習(ML)フレームワークを提案する。
方法: 患者は多変量時系列(MTS)としてモデル化され, 臨床経過と患者と患者の相互作用を捉える。
患者間の類似性は、記述統計学、動的時間ワープ、時間クラスタカーネルなど、MSSベースの手法を用いて定量化される。
これらの類似度尺度は、ロジスティック回帰、ランダムフォレスト、サポートベクトルマシンによるMDR分類の入力として機能し、次元減少とカーネル変換によりモデル性能が向上する。
これらの指標から患者類似性ネットワークを構築した。
スペクトルクラスタリングとt-SNEを用いて、MDR関連サブグループを特定し、ハイリスククラスタを可視化し、臨床関連パターンの洞察を可能にする。
結果: この枠組みはフエンラブラダ大学病院のICU電子健康記録で検証され, AUCは81%であった。
グラフベースの患者類似性を活用することにより、ベースラインMLとディープラーニングモデルを上回っている。
このアプローチでは、抗生物質の長期使用、侵入手順、共感染、ICUの長期滞在など、主要なリスク要因を特定し、臨床的に意味のあるクラスターを明らかにする。
コードと結果は、https://github.com/oscarescuderoarnanz/DM4MTSで公開されている。
結論: 患者類似性表現とグラフに基づく分析を組み合わせることで、正確なMDR予測と解釈可能な洞察を提供する。
この方法は、早期発見、リスクファクターの同定、および患者の階層化をサポートし、クリティカルケアにおける説明可能なMLの可能性を強調する。
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