論文の概要: Hypothesis-free discovery from epidemiological data by automatic detection and local inference for tree-based nonlinearities and interactions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.00571v1
- Date: Thu, 01 May 2025 14:55:22 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-02 19:15:55.341675
- Title: Hypothesis-free discovery from epidemiological data by automatic detection and local inference for tree-based nonlinearities and interactions
- Title(参考訳): 木に基づく非線形性と相互作用の自動検出と局所推論による疫学的データからの仮説なし発見
- Authors: Giorgio Spadaccini, Marjolein Fokkema, Mark A. van de Wiel,
- Abstract要約: RuleSHAPはルールベースの仮説のない発見のためのフレームワークである。
シミュレーションデータにおけるフレームワークの有効性を実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In epidemiological settings, Machine Learning (ML) is gaining popularity for hypothesis-free discovery of risk (or protective) factors. Although ML is strong at discovering non-linearities and interactions, this power is currently compromised by a lack of reliable inference. Although local measures of feature effect can be combined with tree ensembles, uncertainty quantifications for these measures remain only partially available and oftentimes unsatisfactory. We propose RuleSHAP, a framework for using rule-based, hypothesis-free discovery that combines sparse Bayesian regression, tree ensembles and Shapley values in a one-step procedure that both detects and tests complex patterns at the individual level. To ease computation, we derive a formula that computes marginal Shapley values more efficiently for our setting. We demonstrate the validity of our framework on simulated data. To illustrate, we apply our machinery to data from an epidemiological cohort to detect and infer several effects for high cholesterol and blood pressure, such as nonlinear interaction effects between features like age, sex, ethnicity, BMI and glucose level.
- Abstract(参考訳): 疫学的な環境では、機械学習(ML)はリスク(または保護)要因の仮説のない発見で人気を集めている。
MLは非線形性や相互作用の発見に長けているが、現時点でこのパワーは信頼性の高い推論の欠如によって損なわれている。
特徴効果の局所測度は木のアンサンブルと組み合わせることができるが、これらの測度の不確実性定量化は部分的にのみ利用可能であり、しばしば満足できない。
本稿では,ルールベースで仮説なしな発見を行うフレームワークであるStrugSHAPを提案する。このフレームワークは,個々のレベルで複雑なパターンを検出し,検証するワンステップの手順で,疎度ベイズ回帰,木アンサンブル,シェープリー値を組み合わせたものだ。
計算の容易化のために, 限界シェープ値をより効率的に計算する式を導出する。
シミュレーションデータにおけるフレームワークの有効性を実証する。
本研究は, 年齢, 性別, 民族性, BMI, グルコースレベルなどの特徴間の非線形相互作用効果など, 高コレステロールおよび血圧に対するいくつかの影響を検出および推測するために, 疫学的コホートからのデータに適用する。
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