論文の概要: Total Variation-Based Image Decomposition and Denoising for Microscopy Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2505.08843v1
- Date: Tue, 13 May 2025 14:14:00 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-15 21:44:09.255097
- Title: Total Variation-Based Image Decomposition and Denoising for Microscopy Images
- Title(参考訳): 顕微鏡画像における全変量に基づく画像分解とデノイング
- Authors: Marco Corrias, Giada Franceschi, Michele Riva, Alberto Tampieri, Karin Föttinger, Ulrike Diebold, Thomas Pock, Cesare Franchini,
- Abstract要約: 実験的に取得された顕微鏡画像は、ノイズやその他の望ましくない信号の存在によって必然的に影響を受ける。
本研究は、全変動(TV)に基づくワークフローによる顕微鏡画像の分解と復調に焦点を当てたものである。
提案手法は,望ましくない信号成分を抽出し,生信号成分から抽出するか,あるいはノイズを除去することによって画像の復元を行う。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.178358125917281
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Experimentally acquired microscopy images are unavoidably affected by the presence of noise and other unwanted signals, which degrade their quality and might hide relevant features. With the recent increase in image acquisition rate, modern denoising and restoration solutions become necessary. This study focuses on image decomposition and denoising of microscopy images through a workflow based on total variation (TV), addressing images obtained from various microscopy techniques, including atomic force microscopy (AFM), scanning tunneling microscopy (STM), and scanning electron microscopy (SEM). Our approach consists in restoring an image by extracting its unwanted signal components and subtracting them from the raw one, or by denoising it. We evaluate the performance of TV-$L^1$, Huber-ROF, and TGV-$L^1$ in achieving this goal in distinct study cases. Huber-ROF proved to be the most flexible one, while TGV-$L^1$ is the most suitable for denoising. Our results suggest a wider applicability of this method in microscopy, restricted not only to STM, AFM, and SEM images. The Python code used for this study is publicly available as part of AiSurf. It is designed to be integrated into experimental workflows for image acquisition or can be used to denoise previously acquired images.
- Abstract(参考訳): 実験的に取得された顕微鏡画像は、ノイズやその他の望ましくない信号の存在によって必然的に影響を受け、品質を低下させ、関連する特徴を隠蔽する可能性がある。
近年,画像取得率の上昇に伴い,現代デノベーションと修復ソリューションの必要性が高まっている。
本研究では, 原子間力顕微鏡(AFM), 走査型トンネル顕微鏡(STM), 走査型電子顕微鏡(SEM)など, 様々な顕微鏡技術から得られた画像に対処する。
提案手法は,望ましくない信号成分を抽出し,生信号成分から抽出するか,あるいはノイズを除去することによって画像の復元を行う。
異なる研究事例において, TV-$L^1$, Huber-ROF, TGV-$L^1$ の評価を行った。
Huber-ROF が最も柔軟であることが証明され、TGV-$L^1$ が最もデノナイジングに適している。
以上の結果から,STM,AFM,SEM画像のみに限らず,この手法を顕微鏡で適用可能であることが示唆された。
この研究で使用されるPythonコードは、AiSurfの一部として公開されている。
画像取得のための実験的なワークフローに統合されるように設計されている。
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