論文の概要: Summarization for Generative Relation Extraction in the Microbiome Domain
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.08647v1
- Date: Tue, 10 Jun 2025 09:58:23 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-11 15:11:42.267215
- Title: Summarization for Generative Relation Extraction in the Microbiome Domain
- Title(参考訳): マイクロバイオーム領域における生成的関係抽出のための要約
- Authors: Oumaima El Khettari, Solen Quiniou, Samuel Chaffron,
- Abstract要約: 腸内マイクロバイオームの相互作用を研究するために, 生成的関係抽出パイプラインを探索する。
専用コーパスにおける予備的な結果から、要約はノイズを低減し、モデルを導くことにより、生成RE性能を向上させることが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.19662978733004596
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We explore a generative relation extraction (RE) pipeline tailored to the study of interactions in the intestinal microbiome, a complex and low-resource biomedical domain. Our method leverages summarization with large language models (LLMs) to refine context before extracting relations via instruction-tuned generation. Preliminary results on a dedicated corpus show that summarization improves generative RE performance by reducing noise and guiding the model. However, BERT-based RE approaches still outperform generative models. This ongoing work demonstrates the potential of generative methods to support the study of specialized domains in low-resources setting.
- Abstract(参考訳): 複雑な低リソースのバイオメディカルドメインである腸内マイクロバイオームの相互作用を研究するために, 生成的関係抽出(RE)パイプラインを探索した。
提案手法は,大規模言語モデル (LLM) との要約を利用して,命令付き生成による関係の抽出に先立って文脈を洗練する。
専用コーパスにおける予備的な結果から、要約はノイズを低減し、モデルを導くことにより、生成RE性能を向上させることが示された。
しかし、BERTベースのREアプローチは生成モデルよりも優れている。
この研究は、低リソース環境における特殊領域の研究を支援するための生成手法の可能性を示すものである。
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