論文の概要: Atherosclerosis through Hierarchical Explainable Neural Network Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.07373v1
- Date: Thu, 10 Jul 2025 01:51:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-11 16:40:15.248008
- Title: Atherosclerosis through Hierarchical Explainable Neural Network Analysis
- Title(参考訳): 階層的説明可能なニューラルネットワーク解析による動脈硬化
- Authors: Irsyad Adam, Steven Swee, Erika Yilin, Ethan Ji, William Speier, Dean Wang, Alex Bui, Wei Wang, Karol Watson, Peipei Ping,
- Abstract要約: 我々は,コホートの文脈における臨床特徴と,個々の患者特有の分子データという,患者の2つの特徴を生かした階層型グラフニューラルネットワークフレームワークを開発した。
ATHENAは、説明可能なAI(XAI)によるサブネットワーククラスタリングを通じて、機械的にインフォームドされた患者サブタイプの発見を可能にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.695531451200501
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: In this work, we study the problem pertaining to personalized classification of subclinical atherosclerosis by developing a hierarchical graph neural network framework to leverage two characteristic modalities of a patient: clinical features within the context of the cohort, and molecular data unique to individual patients. Current graph-based methods for disease classification detect patient-specific molecular fingerprints, but lack consistency and comprehension regarding cohort-wide features, which are an essential requirement for understanding pathogenic phenotypes across diverse atherosclerotic trajectories. Furthermore, understanding patient subtypes often considers clinical feature similarity in isolation, without integration of shared pathogenic interdependencies among patients. To address these challenges, we introduce ATHENA: Atherosclerosis Through Hierarchical Explainable Neural Network Analysis, which constructs a novel hierarchical network representation through integrated modality learning; subsequently, it optimizes learned patient-specific molecular fingerprints that reflect individual omics data, enforcing consistency with cohort-wide patterns. With a primary clinical dataset of 391 patients, we demonstrate that this heterogeneous alignment of clinical features with molecular interaction patterns has significantly boosted subclinical atherosclerosis classification performance across various baselines by up to 13% in area under the receiver operating curve (AUC) and 20% in F1 score. Taken together, ATHENA enables mechanistically-informed patient subtype discovery through explainable AI (XAI)-driven subnetwork clustering; this novel integration framework strengthens personalized intervention strategies, thereby improving the prediction of atherosclerotic disease progression and management of their clinical actionable outcomes.
- Abstract(参考訳): 本研究では,患者の2つの特徴的特徴を生かした階層型グラフ・ニューラルネットワーク・フレームワークを開発することにより,脳動脈硬化のパーソナライズされた分類に関する問題点を考察する。
疾患分類のための現在のグラフベースの手法は、患者固有の分子指紋を検出するが、様々な動脈硬化性軌跡の病原性表現型を理解するための必須要件である、コホート全体の特徴に関する一貫性と理解が欠如している。
さらに、患者サブタイプを理解することは、患者間での病原性相互依存性の共有を伴わずに、孤立して臨床特徴の類似性を考慮することが多い。
これらの課題に対処するために、AtheNA: Atherosclerosis Through Hierarchical Explainable Neural Network Analysisを導入し、統合モダリティ学習を通して新しい階層型ネットワーク表現を構築する。
初回臨床データセット391例を用いて, 分子間相互作用パターンによる臨床像の不均一なアライメントは, 各種塩基性動脈硬化の分類性能を, 受信操作曲線(AUC)以下の領域で最大13%, F1スコアで20%向上させることを示した。
この新たな統合フレームワークは、パーソナライズされた介入戦略を強化し、動脈硬化性疾患の進行予測と臨床作用可能な結果の管理を改善する。
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