論文の概要: Enhanced Prediction of CAR T-Cell Cytotoxicity with Quantum-Kernel Methods
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.22710v1
- Date: Wed, 30 Jul 2025 14:21:32 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-31 16:14:18.254183
- Title: Enhanced Prediction of CAR T-Cell Cytotoxicity with Quantum-Kernel Methods
- Title(参考訳): 量子カーネル法によるCAR T細胞毒性の増強予測
- Authors: Filippo Utro, Meltem Tolunay, Kahn Rhrissorrakrai, Tanvi P. Gujarati, Jie Shi, Sara Capponi, Mirko Amico, Nate Earnest-Noble, Laxmi Parida,
- Abstract要約: キメラ抗原受容体(英: Chimeric antigen receptor、CAR)は、特定の腫瘍細胞を認識し殺傷するために設計されたT細胞である。
新規シグナル伝達成分を共刺激ドメインに統合することにより、CAR T細胞表現型を改変することができる。
特に,データ制約問題における量子コンピューティングの可能性を示す情報が少ない場合には,特定の信号領域や領域の位置に対する学習の改善を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.1356338340947096
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Chimeric antigen receptor (CAR) T-cells are T-cells engineered to recognize and kill specific tumor cells. Through their extracellular domains, CAR T-cells bind tumor cell antigens which triggers CAR T activation and proliferation. These processes are regulated by co-stimulatory domains present in the intracellular region of the CAR T-cell. Through integrating novel signaling components into the co-stimulatory domains, it is possible to modify CAR T-cell phenotype. Identifying and experimentally testing new CAR constructs based on libraries of co-stimulatory domains is nontrivial given the vast combinatorial space defined by such libraries. This leads to a highly data constrained, poorly explored combinatorial problem, where the experiments undersample all possible combinations. We propose a quantum approach using a Projected Quantum Kernel (PQK) to address this challenge. PQK operates by embedding classical data into a high dimensional Hilbert space and employs a kernel method to measure sample similarity. Using 61 qubits on a gate-based quantum computer, we demonstrate the largest PQK application to date and an enhancement in the classification performance over purely classical machine learning methods for CAR T cytotoxicity prediction. Importantly, we show improved learning for specific signaling domains and domain positions, particularly where there was lower information highlighting the potential for quantum computing in data-constrained problems.
- Abstract(参考訳): キメラ抗原受容体(英: Chimeric antigen receptor、CAR)は、特定の腫瘍細胞を認識し殺傷するために設計されたT細胞である。
細胞外ドメインを通じて、CAR T細胞は腫瘍細胞抗原を結合し、CAR Tの活性化と増殖を引き起こす。
これらのプロセスは、CAR T細胞の細胞内領域に存在する共刺激ドメインによって制御される。
新しいシグナル伝達成分を共刺激ドメインに統合することにより、CAR T細胞表現型を改変することができる。
共刺激領域のライブラリをベースとした新しいCAR構造体を同定および実験的に検証することは、そのようなライブラリが定義する膨大な組合せ空間を考えると簡単ではない。
これは、非常にデータに制約があり、十分に検討されていない組合せ問題を引き起こし、実験はすべての組み合わせをアンサンブルする。
本稿では,この課題に対処するために,PQK (Projected Quantum Kernel) を用いた量子アプローチを提案する。
PQKは古典的データを高次元ヒルベルト空間に埋め込み、サンプル類似度を測定するためにカーネル法を用いる。
ゲートベースの量子コンピュータ上で61量子ビットを用いて、CAR T細胞毒性予測のための古典的機械学習手法よりも、これまでで最大のPQK応用と分類性能の向上を実証した。
特に,データ制約問題における量子コンピューティングの可能性を示す情報が少ない場合には,特定の信号領域や領域の位置に対する学習の改善を示す。
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