論文の概要: Semantic Mosaicing of Histo-Pathology Image Fragments using Visual Foundation Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.03524v1
- Date: Tue, 05 Aug 2025 14:51:44 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-06 18:18:56.028182
- Title: Semantic Mosaicing of Histo-Pathology Image Fragments using Visual Foundation Models
- Title(参考訳): 視覚基礎モデルを用いた病理組織像フラグメントのセマンティックモザイク
- Authors: Stefan Brandstätter, Maximilian Köller, Philipp Seeböck, Alissa Blessing, Felicitas Oberndorfer, Svitlana Pochepnia, Helmut Prosch, Georg Langs,
- Abstract要約: 病理組織学では、組織サンプルは標準的な顕微鏡のスライドよりも大きく、複数の断片を縫合する必要がある。
これにより、境界形状マッチングアルゴリズムを用いて、人工的なマウントスライドを再構築する最先端の縫合法が制限される。
本稿では,視覚病理基盤モデルから派生した潜在特徴表現を用いてSemanticStitcherを導入し,周辺領域を同定する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.810454312303919
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In histopathology, tissue samples are often larger than a standard microscope slide, making stitching of multiple fragments necessary to process entire structures such as tumors. Automated stitching is a prerequisite for scaling analysis, but is challenging due to possible tissue loss during preparation, inhomogeneous morphological distortion, staining inconsistencies, missing regions due to misalignment on the slide, or frayed tissue edges. This limits state-of-the-art stitching methods using boundary shape matching algorithms to reconstruct artificial whole mount slides (WMS). Here, we introduce SemanticStitcher using latent feature representations derived from a visual histopathology foundation model to identify neighboring areas in different fragments. Robust pose estimation based on a large number of semantic matching candidates derives a mosaic of multiple fragments to form the WMS. Experiments on three different histopathology datasets demonstrate that SemanticStitcher yields robust WMS mosaicing and consistently outperforms the state of the art in correct boundary matches.
- Abstract(参考訳): 病理組織学では、組織サンプルは標準的な顕微鏡のスライドよりも大きく、腫瘍のような構造全体を処理するのに必要な複数の断片を縫合する。
自動縫合は、スケール分析の前提条件であるが、準備中に組織が失われる可能性、不均一な形態的歪み、染色の不整合、スライド上の不整合による領域の欠如、あるいは組織縁のフランジなどにより困難である。
これにより、境界形状マッチングアルゴリズムを用いて、人工全マウントスライス(WMS)を再構築する最先端の縫合法が制限される。
本稿では,視覚病理基盤モデルから派生した潜在特徴表現を用いたSemanticStitcherを提案する。
多数のセマンティックマッチング候補に基づくロバストポーズ推定は、WMSを形成する複数の断片のモザイクを導出する。
3つの異なる病理組織学的データセットの実験により、SemanticStitcherは堅牢なWMSモザイクを発生し、正しい境界マッチングにおける最先端よりも一貫して優れていることが示された。
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