論文の概要: Exploring Strategies for Personalized Radiation Therapy: Part III Identifying genetic determinants for Radiation Response with Meta Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.08030v1
- Date: Mon, 11 Aug 2025 14:34:18 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-12 21:23:29.144557
- Title: Exploring Strategies for Personalized Radiation Therapy: Part III Identifying genetic determinants for Radiation Response with Meta Learning
- Title(参考訳): パーソナライズド放射線治療の探索 : 第3報 メタラーニングによる放射線応答の遺伝的決定因子の同定
- Authors: Hao Peng, Yuanyuan Zhang, Steve Jiang, Robert Timmerman, John Minna,
- Abstract要約: SF2で測定された放射線感度の1ショット予測のためのメタラーニングフレームワークを提案する。
提案したメタ学習モデルでは,各遺伝子の重要性を微調整によりサンプルによって変化させることができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.83962881667841
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Radiation response in cancer is shaped by complex, patient specific biology, yet current treatment strategies often rely on uniform dose prescriptions without accounting for tumor heterogeneity. In this study, we introduce a meta learning framework for one-shot prediction of radiosensitivity measured by SF2 using cell line level gene expression data. Unlike the widely used Radiosensitivity Index RSI a rank-based linear model trained on a fixed 10-gene signature, our proposed meta-learned model allows the importance of each gene to vary by sample through fine tuning. This flexibility addresses key limitations of static models like RSI, which assume uniform gene contributions across tumor types and discard expression magnitude and gene gene interactions. Our results show that meta learning offers robust generalization to unseen samples and performs well in tumor subgroups with high radiosensitivity variability, such as adenocarcinoma and large cell carcinoma. By learning transferable structure across tasks while preserving sample specific adaptability, our approach enables rapid adaptation to individual samples, improving predictive accuracy across diverse tumor subtypes while uncovering context dependent patterns of gene influence that may inform personalized therapy.
- Abstract(参考訳): がんの放射線応答は複雑で患者固有の生物学によって形成されているが、現在の治療戦略は腫瘍の不均一性を考慮せずに均一な服用処方に頼っていることが多い。
本研究では,細胞線レベルの遺伝子発現データを用いたSF2測定による放射線感度の1ショット予測のためのメタラーニングフレームワークを提案する。
固定された10遺伝子シグネチャに基づいて訓練されたランクベース線形モデルである放射線感度指数RSIとは異なり,提案したメタ学習モデルでは,各遺伝子の重要性を微調整によって変化させることが可能である。
この柔軟性はRSIのような静的モデルの鍵となる制限に対処する。
以上の結果より, メタラーニングは未確認検体に対して堅牢な一般化を実現し, 腺癌や大細胞癌などの放射線感受性の高い腫瘍サブグループで良好に機能することが示唆された。
本研究は,特定の適応性を維持しつつ,タスク間の伝達可能な構造を学習することにより,個々のサンプルへの迅速な適応を可能にし,様々な腫瘍サブタイプの予測精度を向上させるとともに,パーソナライズされた治療に影響を及ぼす遺伝子影響の文脈依存性パターンを明らかにする。
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