論文の概要: Lightweight MRI-Based Automated Segmentation of Pancreatic Cancer with Auto3DSeg
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.21227v1
- Date: Thu, 28 Aug 2025 21:38:06 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-01 19:45:10.881152
- Title: Lightweight MRI-Based Automated Segmentation of Pancreatic Cancer with Auto3DSeg
- Title(参考訳): Auto3DSeg を用いた軽度MRIによる膵癌の自動切除
- Authors: Keshav Jha, William Sharp, Dominic LaBella,
- Abstract要約: SegResNetモデルは、2025年のPANTHER Challengeの一環として、2つのMRIベースの膵腫瘍セグメンテーションタスクで訓練され、評価された。
性能はやや低かったが, 自動デライン化の可能性を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate delineation of pancreatic tumors is critical for diagnosis, treatment planning, and outcome assessment, yet automated segmentation remains challenging due to anatomical variability and limited dataset availability. In this study, SegResNet models, as part of the Auto3DSeg architecture, were trained and evaluated on two MRI-based pancreatic tumor segmentation tasks as part of the 2025 PANTHER Challenge. Algorithm methodology included 5-fold cross-validation with STAPLE ensembling after focusing on an anatomically relevant region-of-interest. The Pancreatic Tumor Segmentation on Diagnostic MRI task 1 training set included 91 T1-weighted arterial contrast-enhanced MRI with expert annotated pancreas and tumor labels. The Pancreatic Tumor Segmentation on MR-Linac task 2 training set used 50 T2-weighted MR-Linac cases with expert annotated pancreas and tumor labels. Algorithm-automated segmentation performance of pancreatic tumor was assessed using Dice Similarity Coefficient (DSC), 5 mm DSC, 95th percentile Hausdorff Distance (HD95), Mean Average Surface Distance (MASD), and Root Mean Square Error (RMSE). For Task 1, the algorithm achieved a DSC of 0.56, 5 mm DSC of 0.73, HD95 of 41.1 mm, MASD of 26.0 mm, and RMSE of 5164 mm. For Task 2, performance decreased, with a DSC of 0.33, 5 mm DSC of 0.50, HD95 of 20.1 mm, MASD of 7.2 mm, and RMSE of 17,203 mm. These findings illustrate the challenges of MRI-based pancreatic tumor segmentation with small datasets, highlighting variability introduced by different MRI sequences. Despite modest performance, the results demonstrate potential for automated delineation and emphasize the need for larger, standardized MRI datasets to improve model robustness and clinical utility.
- Abstract(参考訳): 膵腫瘍の正確な脱線は診断,治療計画,予後評価に重要であるが,解剖学的変動とデータセットの可用性の制限により,自動セグメンテーションは依然として困難である。
In this study, SegResNet model, as as the Auto3DSeg architecture, and evaluation on two MRI-based pancreatic tumor segmentation tasks as part of the 2025 PANTHER Challenge。
アルゴリズム手法は、解剖学的に関係のある関心領域に着目した後、STAPLEアンサンブルを用いた5倍のクロスバリデーションを含む。
診断用MRIタスク1の膵腫瘍切開には, 91T1強調造影MRIと, 専門家のアノテート膵臓, 腫瘍ラベルを併用した。
MR-Linac Task 2 トレーニングセットの膵腫瘍分節は,50 T2-weighted MR-Linac case with expert annotated pancreas and tumor labels を用いた。
Dice similarity Coefficient (DSC), 5 mm DSC, 95th percentile Hausdorff Distance (HD95), Mean Average Surface Distance (MASD), Root Mean Square Error (RMSE) を用いて膵腫瘍の自動分画性能を評価した。
Task 1では、DSCが0.56、DSCが5mm、HD95が41.1mm、MASDが26.0mm、RMSEが5164mmに達した。
タスク2では性能が低下し、DSCは0.33、DSCは5mm、HD95は20.1mm、MASDは7.2mm、RMSEは17,203mmとなった。
以上の結果から,MRIによる膵腫瘍分節化の課題が示唆された。
軽度の性能にもかかわらず、結果は自動デライン化の可能性を示し、モデルの堅牢性と臨床的有用性を改善するために、より大きく標準化されたMRIデータセットの必要性を強調した。
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