論文の概要: In silico Deep Learning Protocols for Label-Free Super-Resolution Microscopy: A Comparative Study of Network Architectures and SNR Dependence
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.21376v1
- Date: Tue, 23 Sep 2025 07:32:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-29 20:57:53.884681
- Title: In silico Deep Learning Protocols for Label-Free Super-Resolution Microscopy: A Comparative Study of Network Architectures and SNR Dependence
- Title(参考訳): ラベルフリー超解像顕微鏡のためのシリコンディープラーニングプロトコル:ネットワークアーキテクチャとSNR依存性の比較検討
- Authors: Shiraz S Kaderuppan, Jonathan Mar, Andrew Irvine, Anurag Sharma, Muhammad Ramadan Saifuddin, Wai Leong Eugene Wong, Wai Lok Woo,
- Abstract要約: 光学顕微鏡学者によってしばしば引用される重要な制限は、横方向の分解能の限界を指す。
本研究は,超高分解能(SR)光学顕微鏡の実現に向けた代替的,経済的アプローチを評価することを目的とする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.165323448459655
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The field of optical microscopy spans across numerous industries and research domains, ranging from education to healthcare, quality inspection and analysis. Nonetheless, a key limitation often cited by optical microscopists refers to the limit of its lateral resolution (typically defined as ~200nm), with potential circumventions involving either costly external modules (e.g. confocal scan heads, etc) and/or specialized techniques [e.g. super-resolution (SR) fluorescent microscopy]. Addressing these challenges in a normal (non-specialist) context thus remains an aspect outside the scope of most microscope users & facilities. This study thus seeks to evaluate an alternative & economical approach to achieving SR optical microscopy, involving non-fluorescent phase-modulated microscopical modalities such as Zernike phase contrast (PCM) and differential interference contrast (DIC) microscopy. Two in silico deep neural network (DNN) architectures which we developed previously (termed O-Net and Theta-Net) are assessed on their abilities to resolve a custom-fabricated test target containing nanoscale features calibrated via atomic force microscopy (AFM). The results of our study demonstrate that although both O-Net and Theta-Net seemingly performed well when super-resolving these images, they were complementary (rather than competing) approaches to be considered for image SR, particularly under different image signal-to-noise ratios (SNRs). High image SNRs favoured the application of O-Net models, while low SNRs inclined preferentially towards Theta-Net models. These findings demonstrate the importance of model architectures (in conjunction with the source image SNR) on model performance and the SR quality of the generated images where DNN models are utilized for non-fluorescent optical nanoscopy, even where the same training dataset & number of epochs are being used.
- Abstract(参考訳): 光学顕微鏡の分野は、教育から医療、品質検査、分析まで、多くの産業や研究領域にまたがっている。
しかしながら、光学顕微鏡学者によってしばしば引用される重要な制限は、その横分解能(通常、200nmと定義される)の限界であり、コストのかかる外部モジュール(例えば、共焦点走査ヘッドなど)や特殊な技術(例えば、超解像(SR)蛍光顕微鏡)を含む潜在的な回避である。
したがって、通常の(特殊でない)コンテキストでこれらの課題に対処することは、ほとんどの顕微鏡使用者や施設の範囲外である。
そこで本研究では,Zernike 位相コントラスト (PCM) や差分差コントラスト (DIC) 顕微鏡のような非蛍光位相変調顕微鏡を用いた,SR光顕微鏡の代替的,経済的アプローチについて検討する。
従来開発した2種類のシリコンディープニューラルネットワーク(DNN)アーキテクチャ(O-NetとTheta-Net)を,原子間力顕微鏡(AFM)で校正したナノスケール機能を含むカスタムファブリックテストターゲットの解決能力に基づいて評価した。
以上の結果から,O-Net と Theta-Net はどちらも画像の超解法において良好に機能したように見えるが,画像SR,特に画像信号-雑音比(SNR)の相補的なアプローチであったことが示唆された。
画像SNRはO-Netモデルを好んだが、低SNRはTheta-Netモデルを好んだ。
これらの結果から,DNNモデルを用いた非蛍光光ナノスコープにおいて,モデルアーキテクチャ(ソース画像SNRとともに)がモデル性能およびSR品質に与える影響が示唆された。
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