論文の概要: Left Atrial Segmentation with nnU-Net Using MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.04071v1
- Date: Thu, 06 Nov 2025 05:23:45 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-07 20:17:53.309862
- Title: Left Atrial Segmentation with nnU-Net Using MRI
- Title(参考訳): MRIを用いた nnU-Net による左房分節の1例
- Authors: Fatemeh Hosseinabadi, Seyedhassan Sharifi,
- Abstract要約: 近年, 深層学習法は, 医用画像のセグメンテーションタスクにおいて, 優れた性能を示した。
本研究では,自己構成型ディープラーニングセグメンテーションアーキテクチャであるnnU-Netフレームワークを左心房チャレンジ2013データセットに適用した。
このネットワークは左心房形態、肺コントラスト、画像品質の変動にまたがって堅牢な一般化を示し、心房体と近位静脈の両方を正確に描写した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of the left atrium (LA) from cardiac MRI is critical for guiding atrial fibrillation (AF) ablation and constructing biophysical cardiac models. Manual delineation is time-consuming, observer-dependent, and impractical for large-scale or time-sensitive clinical workflows. Deep learning methods, particularly convolutional architectures, have recently demonstrated superior performance in medical image segmentation tasks. In this study, we applied the nnU-Net framework, an automated, self-configuring deep learning segmentation architecture, to the Left Atrial Segmentation Challenge 2013 dataset. The dataset consists of thirty MRI scans with corresponding expert-annotated masks. The nnU-Net model automatically adapted its preprocessing, network configuration, and training pipeline to the characteristics of the MRI data. Model performance was quantitatively evaluated using the Dice similarity coefficient (DSC), and qualitative results were compared against expert segmentations. The proposed nnUNet model achieved a mean Dice score of 93.5, demonstrating high overlap with expert annotations and outperforming several traditional segmentation approaches reported in previous studies. The network exhibited robust generalization across variations in left atrial shape, contrast, and image quality, accurately delineating both the atrial body and proximal pulmonary veins.
- Abstract(参考訳): 心臓MRIによる左房 (LA) の正確な分画は心房細動 (AF) の誘導と生体物理心モデルの構築に重要である。
手動記述は、時間を要する、観察者に依存し、大規模または時間に敏感な臨床ワークフローには実用的ではない。
深層学習、特に畳み込み型アーキテクチャは、最近、医用画像のセグメンテーションタスクにおいて優れた性能を示している。
本研究では,自己構成型ディープラーニングセグメンテーションアーキテクチャであるnnU-Netフレームワークを左心房セグメンテーションチャレンジ2013データセットに適用した。
データセットは30個のMRIスキャンとそれに対応する専門家注釈付きマスクで構成されている。
nnU-NetモデルはMRIデータの特徴に前処理、ネットワーク構成、トレーニングパイプラインを自動的に適応させる。
モデル性能をDice similarity coefficient (DSC) を用いて定量的に評価し, エキスパートセグメンテーションと比較した。
提案したnnUNetモデルはDiceスコアの平均93.5を達成し、エキスパートアノテーションと高い重なり合いを示し、以前の研究で報告されたいくつかの従来のセグメンテーションアプローチを上回った。
ネットワークは左心房形態,コントラスト,画像品質の変動にまたがって堅牢な一般化を示し,心房体と近位肺静脈の両方を正確に描写した。
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