論文の概要: Optimizing Quantum Data Embeddings for Ligand-Based Virtual Screening
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.16177v1
- Date: Thu, 18 Dec 2025 04:56:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-19 18:10:31.917204
- Title: Optimizing Quantum Data Embeddings for Ligand-Based Virtual Screening
- Title(参考訳): リガンドによる仮想スクリーニングのための量子データ埋め込みの最適化
- Authors: Junggu Choi, Tak Hur, Seokhoon Jeong, Kyle L. Jung, Jun Bae Park, Junho Lee, Jae U. Jung, Daniel K. Park,
- Abstract要約: 分子表現を効果的に生成するための量子古典的ハイブリッド埋め込み手法のファミリーを開発し評価する。
複数のターゲットとクラス不均衡設定にまたがって、いくつかの量子的およびハイブリッドな埋め込み変種は古典的ベースラインを一貫して上回る。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.298261599142478
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Effective molecular representations are essential for ligand-based virtual screening. We investigate how quantum data embedding strategies can improve this task by developing and evaluating a family of quantum-classical hybrid embedding approaches. These approaches combine classical neural networks with parameterized quantum circuits in different ways to generate expressive molecular representations and are assessed across two benchmark datasets of different sizes: the LIT-PCBA and COVID-19 collections. Across multiple biological targets and class-imbalance settings, several quantum and hybrid embedding variants consistently outperform classical baselines, especially in limited-data regimes. These results highlight the potential of optimized quantum data embeddings as data-efficient tools for ligand-based virtual screening.
- Abstract(参考訳): リガンドベースの仮想スクリーニングには効果的な分子表現が不可欠である。
量子-古典的ハイブリッド埋め込み手法のファミリーを開発し,評価することにより,量子データ埋め込み戦略がこの課題をどう改善するかを検討する。
これらのアプローチは、古典的ニューラルネットワークとパラメータ化された量子回路を異なる方法で組み合わせて表現的な分子表現を生成し、LIT-PCBAとCOVID-19コレクションという2つの異なるサイズのベンチマークデータセットで評価される。
複数の生物学的ターゲットとクラス不均衡設定にわたって、いくつかの量子およびハイブリッド埋め込み変種は古典的ベースライン、特に限定データレシエーションよりも一貫して優れている。
これらの結果は、リガンドベースの仮想スクリーニングのためのデータ効率ツールとして、最適化された量子データ埋め込みの可能性を強調している。
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