論文の概要: Automated Lesion Segmentation of Stroke MRI Using nnU-Net: A Comprehensive External Validation Across Acute and Chronic Lesions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.08701v1
- Date: Tue, 13 Jan 2026 16:29:20 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-14 18:27:19.285448
- Title: Automated Lesion Segmentation of Stroke MRI Using nnU-Net: A Comprehensive External Validation Across Acute and Chronic Lesions
- Title(参考訳): nnU-Netを用いた脳卒中MRIの自動病変分割:急性および慢性病変の総合的外的検証
- Authors: Tammar Truzman, Matthew A. Lambon Ralph, Ajay D. Halai,
- Abstract要約: 複数のMRIデータセットにまたがるnU-Netフレームワークを用いて脳卒中病変のセグメンテーションを評価する。
脳卒中期にはモデルが頑健な一般化を示し, セグメンテーション精度はレータ間信頼性に近づいた。
急性期において、DWIで訓練されたモデルはFLAIRベースのモデルより一貫して優れており、マルチモーダルの組み合わせからわずかに利益を得ただけだった。
慢性期脳卒中では、トレーニングセットのサイズが増加し、数百件以上のリターンが低下した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate and generalisable segmentation of stroke lesions from magnetic resonance imaging (MRI) is essential for advancing clinical research, prognostic modelling, and personalised interventions. Although deep learning has improved automated lesion delineation, many existing models are optimised for narrow imaging contexts and generalise poorly to independent datasets, modalities, and stroke stages. Here, we systematically evaluated stroke lesion segmentation using the nnU-Net framework across multiple heterogeneous, publicly available MRI datasets spanning acute and chronic stroke. Models were trained and tested on diffusion-weighted imaging (DWI), fluid-attenuated inversion recovery (FLAIR), and T1-weighted MRI, and evaluated on independent datasets. Across stroke stages, models showed robust generalisation, with segmentation accuracy approaching reported inter-rater reliability. Performance varied with imaging modality and training data characteristics. In acute stroke, DWI-trained models consistently outperformed FLAIR-based models, with only modest gains from multimodal combinations. In chronic stroke, increasing training set size improved performance, with diminishing returns beyond several hundred cases. Lesion volume was a key determinant of accuracy: smaller lesions were harder to segment, and models trained on restricted volume ranges generalised poorly. MRI image quality further constrained generalisability: models trained on lower-quality scans transferred poorly, whereas those trained on higher-quality data generalised well to noisier images. Discrepancies between predictions and reference masks were often attributable to limitations in manual annotations. Together, these findings show that automated lesion segmentation can approach human-level performance while identifying key factors governing generalisability and informing the development of lesion segmentation tools.
- Abstract(参考訳): 臨床研究の進展,予後モデリング,パーソナライズド・介入にはMRIによる脳卒中病変の正確な分節化が不可欠である。
ディープラーニングは、自動的な病変のデライン化を改善しているが、多くの既存のモデルは、狭い画像のコンテキストに最適化され、独立したデータセット、モダリティ、脳卒中ステージに十分に一般化されている。
そこで我々は,急性脳梗塞と慢性脳梗塞にまたがる複数のMRIデータセットにまたがるnnU-Netフレームワークを用いて,脳梗塞のセグメンテーションを系統的に評価した。
拡散強調画像(DWI)、流体減衰インバージョンリカバリ(FLAIR)、T1強調MRIを訓練し、独立したデータセットで評価した。
脳卒中期にはモデルが頑健な一般化を示し, セグメンテーション精度はレータ間信頼性に近づいた。
画像のモダリティとトレーニングデータ特性により、性能が変化した。
急性期において、DWIで訓練されたモデルはFLAIRベースのモデルより一貫して優れており、マルチモーダルの組み合わせからわずかに利益を得ただけだった。
慢性期脳卒中では、トレーニングセットのサイズが増加し、数百件以上のリターンが低下した。
病変の縮小はセグメント化が困難であり、制限された容積範囲で訓練されたモデルは一般化が不十分であった。
低品質スキャンでトレーニングされたモデルでは、低品質スキャンでトレーニングされたモデルでは、ノイズの多い画像に対して、高品質なデータでトレーニングされたモデルでは一般化された。
予測と参照マスクの相違は、しばしば手動のアノテーションの制限に起因する。
以上より, 自動的病変分割は, 汎用性を決定する重要な要因を特定し, 病変分割ツールの開発を促すとともに, 人体レベルの性能にアプローチできることが示唆された。
関連論文リスト
- Robust Brain Tumor Segmentation with Incomplete MRI Modalities Using Hölder Divergence and Mutual Information-Enhanced Knowledge Transfer [10.66488607852885]
不完全なモダリティであっても高いセグメンテーション精度を実現する頑健な単一モード並列処理フレームワークを提案する。
モデルでは、利用可能な入力に基づいてネットワークパラメータを動的に調整しながら、モダリティ固有の特徴を維持している。
これらのばらつきと情報に基づく損失関数を用いることで、このフレームワークは予測と地味ラベルの差異を効果的に定量化する。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-07-02T00:18:07Z) - A Unified Model for Compressed Sensing MRI Across Undersampling Patterns [69.19631302047569]
様々な計測アンサンプパターンと画像解像度に頑健な統合MRI再構成モデルを提案する。
我々のモデルは、拡散法よりも600$times$高速な推論で、最先端CNN(End-to-End VarNet)の4dBでSSIMを11%改善し、PSNRを4dB改善する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-10-05T20:03:57Z) - Dimensionality Reduction and Nearest Neighbors for Improving Out-of-Distribution Detection in Medical Image Segmentation [1.2873975765521795]
この研究は、肝臓を分断する4つのSwin UNETRとnnU-netモデルのボトルネック特徴にマハラノビス距離(MD)ポストホックを適用した。
モデルが失敗した画像は、高性能で最小の計算負荷で検出された。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-08-05T18:24:48Z) - Unveiling Incomplete Modality Brain Tumor Segmentation: Leveraging Masked Predicted Auto-Encoder and Divergence Learning [6.44069573245889]
脳腫瘍のセグメンテーションは、特にマルチモーダルMRI(Multi-modal magnetic resonance imaging)における重要な課題である。
本稿では,不完全なモダリティデータから頑健な特徴学習を可能にする,マスク付き予測事前学習方式を提案する。
微調整段階において、我々は知識蒸留技術を用いて、完全なモダリティデータと欠落したモダリティデータの間に特徴を整列させ、同時にモデルロバスト性を向上する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-06-12T20:35:16Z) - Guided Reconstruction with Conditioned Diffusion Models for Unsupervised Anomaly Detection in Brain MRIs [35.46541584018842]
Unsupervised Anomaly Detection (UAD) は、正常なトレーニング分布から異常を外れ値として識別することを目的としている。
生成モデルは、与えられた入力画像に対する健康な脳解剖の再構築を学ぶために使用される。
本稿では,入力画像の潜在表現から得られた付加情報を用いて拡散モデルの復調過程を条件付けることを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-07T11:03:42Z) - On Sensitivity and Robustness of Normalization Schemes to Input
Distribution Shifts in Automatic MR Image Diagnosis [58.634791552376235]
深層学習(DL)モデルは、再構成画像を入力として、複数の疾患の診断において最先端のパフォーマンスを達成した。
DLモデルは、トレーニングとテストフェーズ間の入力データ分布の変化につながるため、さまざまなアーティファクトに敏感である。
本稿では,グループ正規化やレイヤ正規化といった他の正規化手法を用いて,画像のさまざまなアーチファクトに対して,モデル性能にロバスト性を注入することを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-06-23T03:09:03Z) - Reliable Joint Segmentation of Retinal Edema Lesions in OCT Images [55.83984261827332]
本稿では,信頼性の高いマルチスケールウェーブレットエンハンストランスネットワークを提案する。
本研究では,ウェーブレット型特徴抽出器ネットワークとマルチスケール変圧器モジュールを統合したセグメンテーションバックボーンを開発した。
提案手法は,他の最先端セグメンテーション手法と比較して信頼性の高いセグメンテーション精度を実現する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-12-01T07:32:56Z) - Negligible effect of brain MRI data preprocessing for tumor segmentation [36.89606202543839]
我々は3つの公開データセットの実験を行い、ディープニューラルネットワークにおける異なる前処理ステップの効果を評価する。
その結果、最も一般的な標準化手順は、ネットワーク性能に何の価値も与えないことが示されている。
画像の規格化に伴う信号分散の低減のため,画像強度正規化手法はモデル精度に寄与しない。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-04-11T17:29:36Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。