論文の概要: Computer vision-based estimation of invertebrate biomass
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.06362v1
- Date: Fri, 06 Mar 2026 15:12:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-09 13:17:46.018761
- Title: Computer vision-based estimation of invertebrate biomass
- Title(参考訳): コンピュータビジョンによる無脊椎動物のバイオマス推定
- Authors: Mikko Impiö, Philipp M. Rehsen, Jarrett Blair, Cecilie Mielec, Arne J. Beermann, Florian Leese, Toke T. Høye, Jenni Raitoharju,
- Abstract要約: 本研究は, 試料の撮影以外の手作業を必要としないドライマッサージのための2つの手法を提案する。
予測器として面積と沈み込み速度を用いることを提案する。
本手法は, 複雑で視覚的に多様な標本形態であっても, 標本乾物量を推定できることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.9233638471548928
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The ability to estimate invertebrate biomass using only images could help scaling up quantitative biodiversity monitoring efforts. Computer vision-based methods have the potential to omit the manual, time-consuming, and destructive process of dry weighing specimens. We present two approaches for dry mass estimation that do not require additional manual effort apart from imaging the specimens: fitting a linear model with novel predictors, automatically calculated by an imaging device, and training a family of end-to-end deep neural networks for the task, using single-view, multi-view, and metadata-aware architectures. We propose using area and sinking speed as predictors. These can be calculated with BIODISCOVER, which is a dual-camera system that captures image sequences of specimens sinking in an ethanol column. For this study, we collected a large dataset of dry mass measurement and image sequence pairs to train and evaluate models. We show that our methods can estimate specimen dry mass even with complex and visually diverse specimen morphologies. Combined with automatic taxonomic classification, our approach is an accurate method for group-level dry mass estimation, with a median percentage error of 10-20% for individuals. We highlight the importance of choosing appropriate evaluation metrics, and encourage using both percentage errors and absolute errors as metrics, because they measure different properties. We also explore different optimization losses, data augmentation methods, and model architectures for training deep-learning models.
- Abstract(参考訳): 画像のみを用いて無脊椎動物のバイオマスを推定する能力は、定量的生物多様性モニタリングの取り組みのスケールアップに役立つ。
コンピュータビジョンに基づく手法は、乾いた重量の標本のマニュアル、時間、破壊的な過程を省略する可能性がある。
本稿では,新しい予測器を線形モデルに取り付け,画像装置で自動的に計算し,単一ビュー,マルチビュー,メタデータ対応アーキテクチャを用いて,終端から終端までの深層ニューラルネットワーク群を訓練する。
予測器として面積と沈み込み速度を用いることを提案する。
これらは、エタノールカラムに沈む検体の画像シーケンスをキャプチャするデュアルカメラシステムであるBIODISCOVERで計算することができる。
本研究では,乾式質量測定と画像シーケンスペアの大規模なデータセットを収集し,モデルの訓練と評価を行った。
本手法は, 複雑で視覚的に多様な標本形態であっても, 標本乾物量を推定できることを示す。
本手法は, 自動分類と組み合わせて, グループレベルの乾物質量推定の精度の高い手法であり, 個人に対する中央値の誤差は10~20%である。
我々は、適切な評価指標を選択することの重要性を強調し、異なる特性を測定するため、パーセンテージエラーと絶対エラーの両方をメトリクスとして使用することを奨励する。
また、異なる最適化損失、データ拡張方法、ディープラーニングモデルのトレーニングのためのモデルアーキテクチャについても検討する。
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